Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76558 Date Thu Jan 5 12:24:36 GMT 2012 Unique Job ID 3e1b2ff60c958c08

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	D	Q	L	K	Q	S	A	L	D	F	H	E	F	P	V	P	G	K	I	Q	V	S	P	T	K	P	L	A	T	Q	R	D	L	A	L	A	Y	S	P	G	V	A	A	P	C	L	E	I	E	K	D	P	L	K	A	Y	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?													?		?	?	?											?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	A	R	G	N	L	V	A	V	I	S	N	G	T	A	V	L	G	L	G	N	I	G	A	L	A	G	K	P	V	M	E	G	K	G	V	L	F	K	K	F	A	G	I	D	V	F	D	I	E	V	D	E	L	D	P	D	K	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	V	V	A	A	L	E	P	T	F	G	G	I	N	L	E	D	I	K	A	P	E	C	F	Y	I	E	Q	K	L	R	E	R	M	N	I	P	V	F	H	D	D	Q	H	G	T	A	I	I	S	T	A	A	I	L	N	G	L	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	E	K	N	I	S	D	V	R	M	V	V	S	G	A	G	A	A	A	I	A	C	M	N	L	L	V	A	L	G	L	Q	K	H	N	I	V	V	C	D	S	K	G	V	I	Y	Q	G	R	E	P	N	M	A	E	T	K	A	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																															?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	V	V	D	D	G	K	R	T	L	D	D	V	I	E	G	A	D	I	F	L	G	C	S	G	P	K	V	L	T	Q	E	M	V	K	K	M	A	R	A	P	M	I	L	A	L	A	N	P	E	P	E	I	L	P	P	L	A	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	R	P	D	A	I	I	C	T	G	R	S	D	Y	P	N	Q	V	N	N	V	L	C	F	P	F	I	F	R	G	A	L	D	V	G	A	T	A	I	N	E	E	M	K	L	A	A	V	R	A	I	A	E	L	A	H	A	E	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	V	V	A	S	A	Y	G	D	Q	D	L	S	F	G	P	E	Y	I	I	P	K	P	F	D	P	R	L	I	V	K	I	A	P	A	V	A	K	A	A	M	E	S	G	V	A	T	R	P	I	A	D	F	D	V	Y	I	D	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?		?	?									?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	E	F	V	Y	K	T	N	L	F	M	K	P	I	F	S	Q	A	R	K	A	P	K	R	V	V	L	P	E	G	E	E	A	R	V	L	H	A	T	Q	E	L	V	T	L	G	L	A	K	P	I	L	I	G	R	P	N	V	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		M	R	I	Q	K	L	G	L	Q	I	K	A	G	V	D	F	E	I	V	N	N	E	S	D	P	R	F	K	E	Y	W	T	E	Y	F	Q	I	M	K	R	R	G	V	T	Q	E	Q	A	Q	R	A	L	I	S	N	P	T	V	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	I	M	V	Q	R	G	E	A	D	A	M	I	C	G	T	V	G	D	Y	H	E	H	F	S	V	V	K	N	V	F	G	Y	R	D	G	V	H	T	A	G	A	M	N	A	L	L	L	P	S	G	N	T	F	I	A	D	T	Y	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?			?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		N	D	E	P	D	A	E	E	L	A	E	I	T	L	M	A	A	E	T	V	R	R	F	G	I	E	P	R	V	A	L	L	S	H	S	N	F	G	S	S	D	C	P	S	S	S	K	M	R	Q	A	L	E	L	V	R	E	R	A	P
Secondary structure
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Disorder																																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		E	L	M	I	D	G	E	M	H	G	D	A	A	L	V	E	A	I	R	N	D	R	M	P	D	S	S	L	K	G	S	A	N	I	L	V	M	P	N	M	E	A	A	R	I	S	Y	N	L	L	R	V	S	S	S	E	G	V	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	P	V	L	M	G	V	A	K	P	V	H	V	L	T	P	I	A	S	V	R	R	I	V	N	M	V	A	L	A	V	V	E	A	Q	T	Q	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand