Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75831 Date Thu Jan 5 12:14:48 GMT 2012 Unique Job ID 3a25593692bfb9aa

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	P	L	L	E	L	K	D	I	R	R	S	Y	P	A	G	D	E	Q	V	E	V	L	K	G	I	S	L	D	I	Y	A	G	E	M	V	A	I	V	G	A	S	G	S	G	K	S	T	L	M	N	I	L	G	C	L	D	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	S	G	T	Y	R	V	A	G	Q	D	V	A	T	L	D	A	D	A	L	A	Q	L	R	R	E	H	F	G	F	I	F	Q	R	Y	H	L	L	S	H	L	T	A	E	Q	N	V	E	V	P	A	V	Y	A	G	L	E	R	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?																																							?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	L	L	R	A	Q	E	L	L	Q	R	L	G	L	E	D	R	T	E	Y	Y	P	A	Q	L	S	G	G	Q	Q	Q	R	V	S	I	A	R	A	L	M	N	G	G	Q	V	I	L	A	D	E	P	T	G	A	L	D	S	H	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	E	V	M	A	I	L	H	Q	L	R	D	R	G	H	T	V	I	I	V	T	H	D	P	Q	V	A	A	Q	A	E	R	V	I	E	I	R	D	G	E	I	V	R	N	P	P	A	I	E	K	V	N	V	T	G	G	T	E	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	N	T	V	S	G	W	R	Q	F	V	S	G	F	N	E	A	L	T	M	A	W	R	A	L	A	A	N	K	M	R	T	L	L	T	M	L	G	I	I	I	G	I	A	S	V	V	S	I	V	V	V	G	D	A	A	K	Q	M	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	A	D	I	R	S	I	G	T	N	T	I	D	V	Y	P	G	K	D	F	G	D	D	D	P	Q	Y	Q	Q	A	L	K	Y	D	D	L	I	A	I	Q	K	Q	P	W	V	A	S	A	T	P	A	V	S	Q	N	L	R	L	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	N	V	D	V	A	A	S	A	N	G	V	S	G	D	Y	F	N	V	Y	G	M	T	F	S	E	G	N	T	F	N	Q	E	Q	L	N	G	R	A	Q	V	V	V	L	D	S	N	T	R	R	Q	L	F	P	H	K	A	D	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																					?																?		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	E	V	I	L	V	G	N	M	P	A	R	V	I	G	V	A	E	E	K	Q	S	M	F	G	S	S	K	V	L	R	V	W	L	P	Y	S	T	M	S	G	R	V	M	G	Q	S	W	L	N	S	I	T	V	R	V	K	E	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	S	A	E	A	E	Q	Q	L	T	R	L	L	S	L	R	H	G	K	K	D	F	F	T	W	N	M	D	G	V	L	K	T	V	E	K	T	T	R	T	L	Q	L	F	L	T	L	V	A	V	I	S	L	V	V	G	G	I	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		M	N	I	M	L	V	S	V	T	E	R	T	R	E	I	G	I	R	M	A	V	G	A	R	A	S	D	V	L	Q	Q	F	L	I	E	A	V	L	V	C	L	V	G	G	A	L	G	I	T	L	S	L	L	I	A	F	T	L	Q	L
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		F	L	P	G	W	E	I	G	F	S	P	L	A	L	L	L	A	F	L	C	S	T	V	T	G	I	L	F	G	W	L	P	A	R	N	A	A	R	L	D	P	V	D	A	L	A	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																																										?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand