Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A8G0 Date Thu Jan 5 11:07:45 GMT 2012 Unique Job ID 38b01ba5f127d1ce

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	D	Q	F	D	A	K	A	F	L	K	T	V	T	S	Q	P	G	V	Y	R	M	Y	D	A	G	G	T	V	I	Y	V	G	K	A	K	D	L	K	K	R	L	S	S	Y	F	R	S	N	L	A	S	R	K	T	E	A	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																?										?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	Q	I	Q	Q	I	D	V	T	V	T	H	T	E	T	E	A	L	L	L	E	H	N	Y	I	K	L	Y	Q	P	R	Y	N	V	L	L	R	D	D	K	S	Y	P	F	I	F	L	S	G	D	T	H	P	R	L	A	M	H	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	K	H	A	K	G	E	Y	F	G	P	F	P	N	G	Y	A	V	R	E	T	L	A	L	L	Q	K	I	F	P	I	R	Q	C	E	N	S	V	Y	R	N	R	S	R	P	C	L	Q	Y	Q	I	G	R	C	L	G	P	C	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	L	V	S	E	E	E	Y	A	Q	Q	V	E	Y	V	R	L	F	L	S	G	K	D	D	Q	V	L	T	Q	L	I	S	R	M	E	T	A	S	Q	N	L	E	F	E	E	A	A	R	I	R	D	Q	I	Q	A	V	R	R	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	K	Q	F	V	S	N	T	G	D	D	L	D	V	I	G	V	A	F	D	A	G	M	A	C	V	H	V	L	F	I	R	Q	G	K	V	L	G	S	R	S	Y	F	P	K	V	P	G	G	T	E	L	S	E	V	V	E	T	F	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	Q	F	Y	L	Q	G	S	Q	M	R	T	L	P	G	E	I	L	L	D	F	N	L	S	D	K	T	L	L	A	D	S	L	S	E	L	A	G	R	K	I	N	V	Q	T	K	P	R	G	D	R	A	R	Y	L	K	L	A	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	A	A	T	A	L	T	S	K	L	S	Q	Q	S	T	V	H	Q	R	L	T	A	L	A	S	V	L	K	L	P	E	V	K	R	M	E	C	F	D	I	S	H	T	M	G	E	Q	T	V	A	S	C	V	V	F	D	A	N	G	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	R	A	E	Y	R	R	Y	N	I	T	G	I	T	P	G	D	D	Y	A	A	M	N	Q	V	L	R	R	R	Y	G	K	A	I	D	D	S	K	I	P	D	V	I	L	I	D	G	G	K	G	Q	L	A	Q	A	K	N	V	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	L	D	V	S	W	D	K	N	H	P	L	L	L	G	V	A	K	G	A	D	R	K	A	G	L	E	T	L	F	F	E	P	E	G	E	G	F	S	L	P	P	D	S	P	A	L	H	V	I	Q	H	I	R	D	E	S	H	D	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		A	I	G	G	H	R	K	K	R	A	K	V	K	N	T	S	S	L	E	T	I	E	G	V	G	P	K	R	R	Q	M	L	L	K	Y	M	G	G	L	Q	G	L	R	N	A	S	V	E	E	I	A	K	V	P	G	I	S	Q	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
Sequence		A	E	K	I	F	W	S	L	K	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand