Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39357 Date Thu Jan 5 11:59:47 GMT 2012 Unique Job ID 3822ce7586a8e2f0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	L	I	I	V	V	A	G	I	A	L	L	L	L	L	T	I	K	I	K	L	N	T	F	V	S	L	I	I	V	S	I	A	V	A	I	A	S	G	M	D	L	S	K	V	V	T	S	V	E	S	G	L	G	G	T	L	G	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	G	L	I	F	G	F	G	V	M	L	G	R	L	L	A	D	A	G	G	A	Q	R	I	A	L	T	M	L	N	Y	F	G	K	N	K	L	D	W	A	V	V	C	S	A	F	I	V	G	I	A	L	F	F	E	V	G	L	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	V	P	I	L	F	A	I	A	R	E	A	K	I	S	P	M	F	M	C	V	P	M	L	S	G	L	L	V	A	H	G	F	L	P	P	H	P	G	P	T	V	I	A	R	E	Y	G	A	D	V	G	L	V	L	I	Y	G	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	G	I	P	T	F	I	L	C	G	P	V	L	N	K	F	C	Q	R	I	I	P	D	A	F	K	K	E	G	N	I	A	S	L	G	A	T	R	R	F	S	E	S	E	M	P	G	F	G	I	S	F	L	T	A	M	L	P	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	M	A	V	V	T	I	I	Q	M	T	H	A	K	S	A	A	D	S	G	L	F	Y	N	V	I	L	F	L	G	N	S	T	I	A	M	L	I	S	L	L	F	A	I	Y	T	M	G	L	G	R	G	K	T	I	P	D	L	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?																															?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	C	G	K	A	I	A	G	I	A	G	L	L	L	I	I	G	G	G	G	A	F	K	Q	V	L	I	D	S	G	V	G	Q	Y	I	S	T	L	V	S	G	M	D	I	N	P	I	L	M	A	W	G	V	A	A	F	L	R	I	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	G	S	A	T	V	A	A	I	S	T	A	G	L	V	I	P	L	L	A	V	H	P	N	T	N	L	A	L	I	T	L	A	T	G	A	G	S	C	I	C	S	H	V	N	D	A	S	F	W	M	I	K	D	F	F	G	L	T	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		K	E	T	L	L	S	W	T	L	M	S	T	L	L	S	I	S	G	L	I	F	I	L	L	A	S	L	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand