Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P15043 Date Thu Jan 5 11:34:25 GMT 2012 Unique Job ID 36767ccb59c4d678

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	Q	A	E	V	L	N	L	E	S	G	A	K	Q	V	L	Q	E	T	F	G	Y	Q	Q	F	R	P	G	Q	E	E	I	I	D	T	V	L	S	G	R	D	C	L	V	V	M	P	T	G	G	G	K	S	L	C	Y	Q	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	L	L	L	N	G	L	T	V	V	V	S	P	L	I	S	L	M	K	D	Q	V	D	Q	L	Q	A	N	G	V	A	A	A	C	L	N	S	T	Q	T	R	E	Q	Q	L	E	V	M	T	G	C	R	T	G	Q	I	R	L	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	A	P	E	R	L	M	L	D	N	F	L	E	H	L	A	H	W	N	P	V	L	L	A	V	D	E	A	H	C	I	S	Q	W	G	H	D	F	R	P	E	Y	A	A	L	G	Q	L	R	Q	R	F	P	T	L	P	F	M	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	A	T	A	D	D	T	T	R	Q	D	I	V	R	L	L	G	L	N	D	P	L	I	Q	I	S	S	F	D	R	P	N	I	R	Y	M	L	M	E	K	F	K	P	L	D	Q	L	M	R	Y	V	Q	E	Q	R	G	K	S	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	Y	C	N	S	R	A	K	V	E	D	T	A	A	R	L	Q	S	K	G	I	S	A	A	A	Y	H	A	G	L	E	N	N	V	R	A	D	V	Q	E	K	F	Q	R	D	D	L	Q	I	V	V	A	T	V	A	F	G	M	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	K	P	N	V	R	F	V	V	H	F	D	I	P	R	N	I	E	S	Y	Y	Q	E	T	G	R	A	G	R	D	G	L	P	A	E	A	M	L	F	Y	D	P	A	D	M	A	W	L	R	R	C	L	E	E	K	P	Q	G	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	D	I	E	R	H	K	L	N	A	M	G	A	F	A	E	A	Q	T	C	R	R	L	V	L	L	N	Y	F	G	E	G	R	Q	E	P	C	G	N	C	D	I	C	L	D	P	P	K	Q	Y	D	G	S	T	D	A	Q	I	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	T	I	G	R	V	N	Q	R	F	G	M	G	Y	V	V	E	V	I	R	G	A	N	N	Q	R	I	R	D	Y	G	H	D	K	L	K	V	Y	G	M	G	R	D	K	S	H	E	H	W	V	S	V	I	R	Q	L	I	H	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?																	?					?			?					?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	V	T	Q	N	I	A	Q	H	S	A	L	Q	L	T	E	A	A	R	P	V	L	R	G	E	S	S	L	Q	L	A	V	P	R	I	V	A	L	K	P	K	A	M	Q	K	S	F	G	G	N	Y	D	R	K	L	F	A	K	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		K	L	R	K	S	I	A	D	E	S	N	V	P	P	Y	V	V	F	N	D	A	T	L	I	E	M	A	E	Q	M	P	I	T	A	S	E	M	L	S	V	N	G	V	G	M	R	K	L	E	R	F	G	K	P	F	M	A	L	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?																			?	?		?								?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	H	V	D	G	D	D	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand