Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P14081 Date Thu Jan 5 11:33:54 GMT 2012 Unique Job ID 35eef3f2f4b52aa8

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	I	A	T	A	G	H	V	D	H	G	K	T	T	L	L	Q	A	I	T	G	V	N	A	D	R	L	P	E	E	K	K	R	G	M	T	I	D	L	G	Y	A	Y	W	P	Q	P	D	G	R	V	P	G	F	I	D	V	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																								?	?	?	?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	E	K	F	L	S	N	M	L	A	G	V	G	G	I	D	H	A	L	L	V	V	A	C	D	D	G	V	M	A	Q	T	R	E	H	L	A	I	L	Q	L	T	G	N	P	M	L	T	V	A	L	T	K	A	D	R	V	D	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	V	D	E	V	E	R	Q	V	K	E	V	L	R	E	Y	G	F	A	E	A	K	L	F	I	T	A	A	T	E	G	R	G	M	D	A	L	R	E	H	L	L	Q	L	P	E	R	E	H	A	S	Q	H	S	F	R	L	A	I	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	A	F	T	V	K	G	A	G	L	V	V	T	G	T	A	L	S	G	E	V	K	V	G	D	S	L	W	L	T	G	V	N	K	P	M	R	V	R	A	L	H	A	Q	N	Q	P	T	E	T	A	N	A	G	Q	R	I	A	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	A	G	D	A	E	K	E	Q	I	N	R	G	D	W	L	L	A	D	V	P	P	E	P	F	T	R	V	I	V	E	L	Q	T	H	T	P	L	T	Q	W	Q	P	L	H	I	H	H	A	A	S	H	V	T	G	R	V	S	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	D	N	L	A	E	L	V	F	D	T	P	L	W	L	A	D	N	D	R	L	V	L	R	D	I	S	A	R	N	T	L	A	G	A	R	V	V	M	L	N	P	P	R	R	G	K	R	K	P	E	Y	L	Q	W	L	A	S	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?															?	?	?	?	?	?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	A	Q	S	D	A	D	A	L	S	V	H	L	E	R	G	A	V	N	L	A	D	F	A	W	A	R	Q	L	N	G	E	G	M	R	E	L	L	Q	Q	P	G	Y	I	Q	A	G	Y	S	L	L	N	A	P	V	A	A	R	W	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?											?	?	?		?								?	?	?	?										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	K	I	L	D	T	L	A	T	Y	H	E	Q	H	R	D	E	P	G	P	G	R	E	R	L	R	R	M	A	L	P	M	E	D	E	A	L	V	L	L	L	I	E	K	M	R	E	S	G	D	I	H	S	H	H	G	W	L	H	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?		?	?		?							?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		P	D	H	K	A	G	F	S	E	E	Q	Q	A	I	W	Q	K	A	E	P	L	F	G	D	E	P	W	W	V	R	D	L	A	K	E	T	G	T	D	E	Q	A	M	R	L	T	L	R	Q	A	A	Q	Q	G	I	I	T	A	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?																													?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		K	D	R	Y	Y	R	N	D	R	I	V	E	F	A	N	M	I	R	D	L	D	Q	E	C	G	S	T	C	A	A	D	F	R	D	R	L	G	V	G	R	K	L	A	I	Q	I	L	E	Y	F	D	R	I	G	F	T	R	R	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
Sequence		N	D	H	L	L	R	D	A	L	L	F	P	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand