HHsearch 1.5 NAME batch____ FAM FILE query COM //bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i /bmm/www/servers/phyre2/public_html/phyre2_output/358b8adb569fc7a1/query.a3m -o /bmm/www/servers/phyre2/public_html/phyre2_output/358b8adb569fc7a1/query.hhm DATE Thu Jan 12 00:55:42 2012 LENG 347 match states, 347 columns in multiple alignment FILT 71 out of 73 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 6.1 EVD 0.4030 -2.7593 SEQ >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEECCEECCCCC CCCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEECCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHH HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCEEEEEEC CCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEC >ss_conf 9100237899976433211357432321442899668882586114576761899997688988549999954665754434566216898774022332 2222355410015878999999984057569995487165202267999998777375688111585068885556788875425567888754542104 5778865312334466654455551689837871599972456421167627997587765530355304677766554321100111368767998832 43023447862389938823885332157578856887576125429 >Consensus xxxxxxxxxxxxxxxxxaxxxxpxxxxfkDWxvxCDNtxtCxAxgxxxxxxxxlxlxRxaGaxxxxxxxvxxxxxxxxxxxxxxxxxxlxiDGxxlxxxx xxxxxxxxxxxxxxxxxvxalLxalxxxxxlxxxxxxxxiSlxGxxAaLLxmDexQgRxgTxxALvxkGxxpxxxvpxapxipxixxxxxxpxxlxxxxx xxlxxxxxxxxxxxxcxxxxxxxxxxxxxLxxxxxLvxixCxxgAYNxxxxxxxxxxxxpxxxxxxxlxxpxxxxxxxxxxxxxnxxxdpxtgxLxxxxK gRGiGDCGsxxxwxwdGxxFxLxxxxxxxxCxGxxxpgxWPxxwxtr >batch____ MRYRIFLLFFFALLPTSLVWAAPAQRAFSDWQVTCNNQNFCVARNTGDHNGLVMTLSRSAGAHTDAVLRIERGGLKSPEASEGEIAPRLLLDGEPLALSG DKWRISPWLLVTDDTATITAFLQMIQEGKAITLRDGDQTISLSGLKAALLFIDAQQKRVGSETAWIKKGDEPPLSVPPAPALKEVAVVNPTPTPLSLEER NDLLDYGNWRMNGLRCSLDPLRREVNVTALTDDKALMMISCEAGAYNTIDLAWIVSRKKPLASRPVRLRLPFNNGQETNELELMNATFDEKSRELVTLAK GRGLSDCGIQARWRFDGQRFRLVRYAAEPTCDNWHGPDAWPTLWITR >UniRef50_B1XMZ1(48-197:393) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Synechococcus sp. 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