Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75683 Date Thu Jan 5 12:13:04 GMT 2012 Unique Job ID 357be961c2dae767

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	Q	L	T	M	K	D	K	I	G	Y	G	L	G	D	T	A	C	G	F	V	W	Q	A	T	M	F	L	L	A	Y	F	Y	T	D	V	F	G	L	S	A	G	I	M	G	T	L	F	L	V	S	R	V	L	D	A	V	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	L	M	G	L	L	V	D	R	T	R	T	R	H	G	Q	F	R	P	F	L	L	W	G	A	I	P	F	G	I	V	C	V	L	T	F	Y	T	P	D	F	S	A	Q	G	K	I	I	Y	A	C	V	T	Y	I	L	L	T	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	T	F	V	N	V	P	Y	C	A	M	P	G	V	I	T	A	D	P	K	E	R	H	A	L	Q	S	W	R	F	F	L	A	A	A	G	S	L	A	I	S	G	I	A	L	P	L	V	S	I	I	G	K	G	D	E	Q	V	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	G	A	M	C	V	L	G	L	S	G	V	V	L	L	Y	V	C	F	F	T	T	K	E	R	Y	T	F	E	V	Q	P	G	S	S	V	A	K	D	L	K	L	L	L	G	N	S	Q	W	R	I	M	C	A	F	K	M	M	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		C	S	N	V	V	R	G	G	A	T	L	Y	F	V	K	Y	V	M	D	H	P	E	L	A	T	Q	F	L	L	Y	G	S	L	A	T	M	F	G	S	L	C	S	S	R	L	L	G	R	F	D	R	V	T	A	F	K	W	I	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	Y	S	L	I	S	L	L	I	F	V	T	P	A	E	H	I	A	L	I	F	A	L	N	I	L	F	L	F	V	F	N	T	T	T	P	L	Q	W	L	M	A	S	D	V	V	D	Y	E	E	S	R	S	G	R	R	L	D	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	F	S	T	Y	L	F	S	L	K	I	G	L	A	I	G	G	A	V	V	G	W	I	L	A	Y	V	N	Y	S	A	S	S	S	V	Q	P	V	E	V	L	T	T	I	K	I	L	F	C	V	V	P	V	V	L	Y	A	G	M	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Sequence		I	M	L	S	L	Y	K	L	T	D	A	R	V	E	A	I	S	R	Q	L	I	K	H	R	A	A	Q	G	E	A	V	P	D	A	A	T	A	A	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand