Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76372 Date Thu Jan 5 12:22:26 GMT 2012 Unique Job ID 3521ed868d64930c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	V	E	N	N	N	V	S	G	Q	N	H	D	P	E	Q	I	D	L	I	D	L	L	V	Q	L	W	R	G	K	M	T	I	I	I	S	V	I	V	A	I	A	L	A	I	G	Y	L	A	V	A	K	E	K	W	T	S	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	I	T	Q	P	D	V	G	Q	I	A	G	Y	N	N	A	M	N	V	I	Y	G	Q	A	A	P	K	V	S	D	L	Q	E	T	L	I	G	R	F	S	S	A	F	S	A	L	A	E	T	L	D	N	Q	E	E	R	E	K	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	E	P	S	V	K	N	Q	Q	L	P	L	T	V	S	Y	V	G	Q	T	A	E	G	A	Q	M	K	L	A	Q	Y	I	Q	Q	V	D	D	K	V	N	Q	E	L	E	K	D	L	K	D	N	I	A	L	G	R	K	N	L	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	L	R	T	Q	E	V	V	A	Q	E	Q	K	D	L	R	I	R	Q	I	Q	E	A	L	Q	Y	A	N	Q	A	Q	V	T	K	P	Q	I	Q	Q	T	G	E	D	I	T	Q	D	T	L	F	L	L	G	S	E	A	L	E	S	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	K	H	E	A	T	R	P	L	V	F	S	P	N	Y	Y	Q	T	R	Q	N	L	L	D	I	E	S	L	K	V	D	D	L	D	I	H	A	Y	R	Y	V	M	K	P	M	L	P	I	R	R	D	S	P	K	K	A	I	T	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	A	V	L	L	G	G	M	V	G	A	G	I	V	L	G	R	N	A	L	R	N	Y	N	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand