Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75858 Date Thu Jan 5 12:15:07 GMT 2012 Unique Job ID 34abc373566f6b8e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	I	I	F	G	E	K	C	V	S	L	L	R	L	F	F	A	A	V	L	M	L	W	C	A	Q	T	A	A	Y	S	G	Q	C	H	T	T	Q	G	N	P	Y	I	G	V	N	F	G	V	K	T	L	E	E	E	A	N	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																																										?	?	?	?	?				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	V	V	K	D	K	F	Y	Q	W	N	E	S	N	D	Y	Y	V	S	C	D	C	D	K	D	N	V	R	S	G	R	W	A	F	A	A	D	S	P	L	V	Y	L	G	D	N	W	Y	K	I	N	D	Y	L	A	A	K	V	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	V	K	G	S	S	P	T	A	V	P	F	E	N	V	G	T	G	G	D	T	R	W	H	I	C	D	P	G	G	Q	R	L	G	G	Q	G	A	S	G	N	S	G	S	F	S	L	K	I	L	Q	P	F	V	G	S	V	V	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?					?	?		?	?	?	?	?		?	?	?																?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	M	A	L	A	R	L	Y	E	C	Y	N	I	P	A	G	D	S	C	T	T	T	G	T	P	V	L	V	Y	Y	L	S	G	T	I	N	S	L	G	S	C	S	V	N	A	G	E	T	I	E	V	D	L	G	D	V	F	A	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?						?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?		?			?	?		?										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	R	V	V	G	H	K	P	L	G	A	R	T	A	E	L	A	I	P	V	R	C	N	T	G	N	A	G	L	V	N	V	N	L	S	L	T	A	T	T	D	P	S	Y	P	Q	A	I	K	T	S	R	P	G	V	G	V	V	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?		?										?	?	?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Sequence		D	S	Q	N	N	I	I	S	P	A	G	G	T	L	P	L	S	I	P	D	D	A	D	S	I	A	R	M	N	V	Y	P	V	S	T	T	G	V	P	P	E	T	G	R	F	E	A	T	A	T	V	R	I	N	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?			?			?						?	?							?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand