Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P43531 Date Thu Jan 5 12:02:22 GMT 2012 Unique Job ID 32ee7f9f06f121eb

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	R	T	T	T	V	D	G	A	P	A	S	D	T	D	K	Q	S	I	S	Q	P	N	Q	F	I	K	R	G	T	P	Q	F	M	R	V	T	L	A	L	F	S	A	G	L	A	T	F	A	L	L	Y	C	V	Q	P	I	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	L	S	Q	E	F	G	L	T	P	A	N	S	S	I	S	L	S	I	S	T	A	M	L	A	I	G	L	L	F	T	G	P	L	S	D	A	I	G	R	K	P	V	M	V	T	A	L	L	L	A	S	I	C	T	L	L	S	T	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	T	S	W	H	G	I	L	I	M	R	A	L	I	G	L	S	L	S	G	V	A	A	V	G	M	T	Y	L	S	E	E	I	H	P	S	F	V	A	F	S	M	G	L	Y	I	S	G	N	S	I	G	G	M	S	G	R	L	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	V	F	T	D	F	F	N	W	R	I	A	L	A	A	I	G	C	F	A	L	A	S	A	L	M	F	W	K	I	L	P	E	S	R	H	F	R	P	T	S	L	R	P	K	T	L	F	I	N	F	R	L	H	W	R	D	R	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	L	L	F	A	E	G	F	L	L	M	G	S	F	V	T	L	F	N	Y	I	G	Y	R	L	M	L	S	P	W	H	V	S	Q	A	V	V	G	L	L	S	L	A	Y	L	T	G	T	W	S	S	P	K	A	G	T	M	T	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	G	R	G	P	V	M	L	F	S	T	G	V	M	L	F	G	L	L	M	T	L	F	S	S	L	W	L	I	F	A	G	M	L	L	F	S	A	G	F	F	A	A	H	S	V	A	S	S	W	I	G	P	R	A	K	R	A	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																							?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	A	S	S	L	Y	L	F	S	Y	Y	L	G	S	S	I	A	G	T	L	G	G	V	F	W	H	N	Y	G	W	N	G	V	G	A	F	I	A	L	M	L	V	I	A	L	L	V	G	T	R	L	H	R	R	L	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand