Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77306 Date Thu Jan 5 12:27:33 GMT 2012 Unique Job ID 30c5b449a7faa4ff

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	D	I	V	N	S	V	P	S	W	M	F	T	A	I	I	A	V	C	I	L	F	I	I	G	I	I	F	A	R	L	Y	R	R	A	S	A	E	Q	A	F	V	R	T	G	L	G	G	Q	K	V	V	M	S	G	G	A	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	P	I	F	H	E	I	I	P	I	N	M	N	T	L	K	L	E	V	S	R	S	T	I	D	S	L	I	T	K	D	R	M	R	V	D	V	V	V	A	F	F	V	R	V	K	P	S	V	E	G	I	A	T	A	A	Q	T	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?		?		?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	R	T	L	S	P	E	D	L	R	M	L	V	E	D	K	F	V	D	A	L	R	A	T	A	A	Q	M	T	M	H	E	L	Q	D	T	R	E	N	F	V	Q	G	V	Q	N	T	V	A	E	D	L	S	K	N	G	L	E	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	V	S	L	T	N	F	N	Q	T	S	K	E	H	F	N	P	N	N	A	F	D	A	E	G	L	T	K	L	T	Q	E	T	E	R	R	R	R	E	R	N	E	V	E	Q	D	V	E	V	A	V	R	E	K	N	R	D	A	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?		?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	K	L	E	I	E	Q	Q	E	A	F	M	T	L	E	Q	E	Q	Q	V	K	T	R	T	A	E	Q	N	A	R	I	A	A	F	E	A	E	R	R	R	E	A	E	Q	T	R	I	L	A	E	R	Q	I	Q	E	T	E	I	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	Q	A	V	R	S	R	K	V	E	A	E	R	E	V	R	I	K	E	I	E	Q	Q	Q	V	T	E	I	A	N	Q	T	K	S	I	A	I	A	A	K	S	E	Q	Q	S	Q	A	E	A	R	A	N	L	A	L	A	E	A	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	Q	Q	N	V	E	T	T	R	Q	T	A	E	A	D	R	A	K	Q	V	A	L	I	A	A	A	Q	D	A	E	T	K	A	V	E	L	T	V	R	A	K	A	E	K	E	A	A	E	M	Q	A	A	A	I	V	E	L	A	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	R	K	K	G	L	A	E	A	E	A	Q	R	A	L	N	D	A	I	N	V	L	S	D	E	Q	T	S	L	K	F	K	L	A	L	L	Q	A	L	P	A	V	I	E	K	S	V	E	P	M	K	S	I	D	G	I	K	I	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?																																												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	D	G	L	N	R	G	G	A	A	G	D	A	N	T	G	N	V	G	G	G	N	L	A	E	Q	A	L	S	A	A	L	S	Y	R	T	Q	A	P	L	I	D	S	L	L	N	E	I	G	V	S	G	G	S	L	A	A	L	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
Sequence		P	L	T	S	T	T	P	V	E	E	K	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand