Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32715 Date Thu Jan 5 11:50:37 GMT 2012 Unique Job ID 30aed27db6b14bb7

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	A	L	N	S	L	P	L	P	V	V	R	L	L	A	F	F	H	E	E	L	S	E	R	R	P	G	R	V	P	Q	T	V	Q	L	W	V	G	C	L	L	V	I	L	I	S	M	T	F	E	I	P	F	V	A	L	S	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?											?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	L	F	Y	G	I	Q	S	N	A	F	Y	T	K	F	V	A	I	L	F	V	V	A	T	V	L	E	I	G	S	L	F	L	I	Y	K	W	S	Y	G	E	P	L	I	R	L	I	I	A	G	P	I	L	M	G	C	M	F	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	T	H	R	L	G	L	V	F	F	A	V	A	I	V	A	I	Y	G	Q	T	F	P	A	M	L	D	Y	P	E	V	V	V	R	L	T	L	W	C	I	V	V	G	L	Y	P	T	L	L	M	T	L	I	G	V	L	W	F	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	A	I	S	Q	M	H	Q	A	L	N	D	R	L	D	D	A	I	S	H	L	T	D	S	L	A	P	L	P	E	T	R	I	E	R	E	A	L	A	L	Q	K	L	N	V	F	C	L	A	D	D	A	N	W	R	T	Q	N	A	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?			?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		W	Q	S	C	V	A	T	V	T	Y	I	Y	S	T	L	N	R	Y	D	P	T	S	F	A	D	S	Q	A	I	I	E	F	R	Q	K	L	A	S	E	I	N	K	L	Q	H	A	V	A	E	G	Q	C	W	Q	S	D	W	R	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	S	E	A	M	A	A	R	E	C	N	L	E	N	I	C	Q	T	L	L	Q	L	G	Q	M	D	P	N	T	P	P	T	P	A	A	K	P	P	S	M	A	A	D	A	F	T	N	P	D	Y	M	R	Y	A	V	K	T	L	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		C	L	I	C	Y	T	F	Y	S	G	V	D	W	E	G	I	H	T	C	M	L	T	C	V	I	V	A	N	P	N	V	G	S	S	Y	Q	K	M	V	L	R	F	G	G	A	F	C	G	A	I	L	A	L	L	F	T	L	L	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	W	L	D	N	I	V	E	L	L	F	V	L	A	P	I	F	L	L	G	A	W	I	A	T	S	S	E	R	S	S	Y	I	G	T	Q	M	V	V	T	F	A	L	A	T	L	E	N	V	F	G	P	V	Y	D	L	V	E	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	R	A	L	G	I	I	I	G	T	V	V	S	A	V	I	Y	T	F	V	W	P	E	S	E	A	R	T	L	P	Q	K	L	A	G	T	L	G	M	L	S	K	V	M	R	I	P	R	Q	Q	E	V	T	A	L	R	T	Y	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		I	R	I	G	L	H	A	A	F	N	A	C	E	E	M	C	Q	R	V	A	L	E	R	Q	L	D	S	E	E	R	A	L	L	I	E	R	S	Q	T	V	I	R	Q	G	R	D	L	L	H	A	W	D	A	T	W	N	S	A	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	D	N	A	L	Q	P	D	R	A	G	Q	F	A	D	A	L	E	K	Y	A	A	G	L	A	T	A	L	S	R	S	P	Q	I	T	L	E	E	T	P	A	S	Q	A	I	L	P	T	L	L	K	Q	E	Q	H	V	C	Q	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																				?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.
Sequence		A	R	L	P	D	W	T	A	P	A	L	T	P	A	T	E	Q	A	Q	G	A	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand