Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33345 Date Thu Jan 5 11:51:46 GMT 2012 Unique Job ID 2eb665d713b814dd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	H	F	I	Y	Q	D	E	K	S	H	K	F	R	A	V	E	Q	Q	G	N	E	L	H	I	S	W	G	K	V	G	T	K	G	Q	S	Q	I	K	S	F	S	D	A	A	A	A	A	K	A	E	L	K	L	I	A	E	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	K	G	Y	V	E	Q	A	K	D	N	S	L	Q	P	S	Q	T	V	T	G	S	L	K	V	A	D	L	S	T	I	I	Q	E	Q	P	S	F	V	A	E	T	R	A	P	D	K	N	T	D	A	V	L	P	W	L	A	K	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	V	V	F	P	P	E	V	V	H	T	T	L	S	H	R	R	F	P	G	V	P	V	Q	Q	A	D	K	L	P	Q	L	R	R	L	A	C	S	V	S	Q	R	D	N	K	T	A	T	F	D	F	S	A	C	S	L	E	W	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?														?	?	?																																			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	V	A	Q	A	I	S	Q	I	D	G	L	K	T	T	Q	L	P	S	P	V	M	A	V	L	T	A	L	E	M	K	C	T	R	Y	K	V	R	E	D	V	M	D	Q	I	V	Q	E	G	G	L	E	Y	A	T	D	V	I	I	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	Q	Q	I	D	I	E	W	D	Y	A	N	N	V	I	I	I	L	P	S	G	I	A	P	S	Y	L	E	Q	Y	S	R	F	E	X	R	L	R	K	H	L	S	L	T	E	E	S	L	W	Q	K	C	A	Q	K	L	I	A	A	I
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Disorder																?							?	?	?																				?	?														?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	H	I	P	E	W	R	Q	P	L	I	A	L	L	L	P	E	K	P	E	I	A	H	E	I	A	Q	R	L	L	G	Q	K	K	L	P	S	L	E	W	L	K	I	V	A	T	D	E	H	I	L	A	S	L	E	K	Y	H	E	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?																											?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	A	I	F	D	D	Y	Y	C	G	A	I	W	S	A	T	V	L	Q	E	Q	G	V	A	A	L	P	R	F	A	P	Y	A	A	S	D	Y	C	A	D	V	L	R	H	I	N	H	P	F	A	L	T	L	L	I	R	V	A	G	Q
Secondary structure
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Disorder																																																													?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	K	R	C	H	D	R	M	T	K	A	I	A	A	F	P	H	A	A	M	A	A	L	T	E	L	L	G	Q	K	E	E	N	S	W	R	I	M	L	M	T	M	L	I	S	Q	P	A	L	A	E	Q	V	I	P	W	L	S	T	P
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	V	A	V	L	K	S	C	Q	Q	Q	L	T	Q	P	S	N	H	A	S	A	D	L	L	P	A	V	V	V	S	P	P	W	L	S	K	K	K	K	S	P	I	P	V	L	D	L	A	P	L	G	I	E	P	I	C	Y	L	T	E
Secondary structure
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Disorder		?									?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?						?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	I	S	N	Q	L	L	A	K	Y	I	W	Y	S	K	H	I	T	V	S	H	E	E	S	T	T	N	L	L	A	R	M	G	F	Q	R	R	I	A	G	T	Y	I	K	A	P	E	A	V	V	E	A	W	L	N	E	D	Y	S	T
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	L	S	E	F	K	V	F	H	S	P	T	G	H	Y	W	Q	L	G	I	L	T	T	L	P	L	E	K	A	V	K	A	W	N	A	L	T	L	S	P	H	T	D	T	E	Y	S	M	L	H	F	G	L	K	G	L	P	G	L	V
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		N	S	L	A	R	Y	P	Q	E	A	L	P	I	T	N	Y	F	A	A	S	E	L	A	P	A	V	A	R	A	F	N	K	L	K	T	L	R	E	N	A	R	S	W	L	L	K	Y	P	E	H	A	L	T	G	L	L	P	A	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		G	K	A	G	E	A	Q	D	N	A	R	A	A	L	R	M	L	T	E	N	G	H	Q	P	L	L	Q	E	I	A	R	R	Y	N	Q	P	E	V	T	D	A	V	N	A	L	L	A	L	D	P	L	D	N	H	P	T	K	I	P	T
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		L	P	A	F	Y	Q	P	S	L	W	T	R	P	V	L	K	A	N	A	Q	S	L	P	D	S	A	L	L	H	L	G	E	M	L	R	F	P	Q	E	E	A	L	Y	P	G	L	L	Q	V	K	D	V	C	S	A	D	S	L	A	G
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		F	A	W	D	L	F	T	A	W	Q	T	A	G	A	P	S	K	E	S	W	A	F	T	A	L	G	V	L	G	N	D	D	T	A	R	K	L	T	P	L	I	R	A	W	P	G	E	S	Q	H	K	R	A	T	V	G	L	D	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?																																		?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		A	A	I	G	S	D	I	A	L	M	Q	L	N	G	I	A	Q	K	L	K	F	K	A	L	Q	E	R	A	K	E	K	I	A	D	I	A	E	S	R	E	L	T	V	A	E	L	E	D	R	L	A	P	D	L	G	L	D	D	N	G
Secondary structure
SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		S	L	L	L	D	F	G	P	R	Q	F	T	V	S	F	D	E	T	L	K	P	F	V	R	D	V	S	G	S	R	L	K	D	L	P	K	P	N	K	S	D	D	E	T	R	A	N	D	A	V	N	R	Y	K	L	L	K	K	D	A
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SS confidence
Disorder																																					?		?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		R	T	I	A	A	Q	Q	V	A	R	L	E	S	A	M	C	L	R	R	R	W	S	L	E	N	F	Q	L	F	L	V	E	H	P	L	V	R	H	L	T	R	R	L	I	W	G	V	Y	S	A	E	N	Q	L	L	A	C	F	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		A	E	D	N	S	S	S	T	A	D	D	D	L	F	T	L	P	E	G	D	I	S	I	G	T	P	H	V	L	E	I	S	P	T	D	A	A	A	F	G	Q	L	F	A	D	Y	E	L	L	P	P	F	R	Q	L	D	R	N	S	Y
Secondary structure
SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		A	L	T	E	A	E	R	N	A	S	E	L	T	R	W	A	G	R	K	C	P	S	G	R	V	M	G	L	A	N	K	G	W	I	K	G	E	P	Q	D	G	G	W	I	G	W	M	I	K	P	L	G	R	W	S	L	I	M	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?		?	?																			?	?	?	?	?			?
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Sequence		D	E	G	F	A	V	G	M	S	P	A	E	L	S	A	E	Q	L	L	S	K	L	W	L	W	E	G	K	A	E	R	Y	G	W	G	S	N	S	T	Q	E	A	Q	F	S	V	I	D	A	I	T	A	S	E	L	I	N	D	I	E
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Disorder																														?	?	?		?		?	?	?	?	?
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		.	.	.	.
Sequence		A	L	F	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?
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