Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32151 Date Thu Jan 5 11:49:31 GMT 2012 Unique Job ID 2e57db031308cf7e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	R	N	L	L	S	S	A	I	I	V	A	I	M	S	L	G	L	T	G	C	D	D	K	K	A	E	T	E	T	L	P	P	A	N	S	Q	P	A	A	P	A	P	E	A	K	P	T	E	A	P	V	A	K	A	E	A	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	T	P	A	Q	P	V	V	D	E	Q	A	V	F	D	E	K	M	D	V	Y	I	K	C	Y	N	K	L	Q	I	P	V	Q	R	S	L	A	R	Y	A	D	W	L	K	D	F	K	Q	G	P	T	G	E	E	R	T	V	Y	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	G	I	S	E	S	N	L	A	E	C	E	K	G	V	K	S	A	V	A	L	T	P	A	L	Q	P	I	D	G	V	A	V	S	Y	I	D	A	A	V	A	L	G	N	T	I	N	E	M	D	K	Y	Y	T	Q	E	N	Y	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?																														?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	A	F	A	K	G	K	T	L	H	Q	T	F	L	K	N	L	E	A	F	E	P	V	A	E	S	Y	H	A	A	I	Q	E	I	N	D	K	R	Q	L	A	E	L	K	N	I	E	E	R	E	G	K	T	F	H	Y	Y	S	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																													?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	M	I	S	A	K	Q	I	N	N	L	I	S	Q	D	K	F	D	A	E	A	A	M	K	K	V	S	E	L	E	T	L	V	A	Q	A	K	E	A	D	K	G	G	M	N	F	S	F	I	N	S	A	G	Q	Y	Q	L	E	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?		?	?																						?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Sequence		K	Y	V	R	R	I	R	D	K	V	P	Y	S	D	W	D	K	E	Q	L	Q	D	A	N	S	S	W	M	V	E	D	S	F	P	R	A	L	R	E	Y	N	E	M	V	D	D	Y	N	S	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand