Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P28249 Date Thu Jan 5 11:44:34 GMT 2012 Unique Job ID 2dd95a9402b803cf

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	R	F	L	T	T	L	M	I	L	L	V	V	L	V	A	G	L	S	A	L	V	L	L	V	N	P	N	D	F	R	D	Y	M	V	K	Q	V	A	A	R	S	G	Y	Q	L	Q	L	D	G	P	L	R	W	H	V	W	P	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	S	I	L	S	G	R	M	S	L	T	A	Q	G	A	S	Q	P	L	V	R	A	D	N	M	R	L	D	V	A	L	L	P	L	L	S	H	Q	L	S	V	K	Q	V	M	L	K	G	A	V	I	Q	L	T	P	Q	T	E	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?		?																				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	S	E	D	A	P	V	A	P	R	D	N	T	L	P	D	L	S	D	D	R	G	W	S	F	D	I	S	S	L	K	V	A	D	S	V	L	V	F	Q	H	E	D	D	E	Q	V	T	I	R	N	I	R	L	Q	M	E	Q	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?															?	?	?														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	H	R	G	S	F	E	F	S	G	R	V	N	R	D	Q	R	D	L	T	I	S	L	N	G	T	V	D	A	S	D	Y	P	H	D	L	T	A	A	I	E	Q	I	N	W	Q	L	Q	G	A	D	L	P	K	Q	G	I	Q	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?								?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	S	F	Q	A	Q	W	Q	E	S	H	K	R	L	S	F	N	Q	I	S	L	T	A	N	D	S	T	L	S	G	Q	A	Q	V	T	L	T	E	K	P	E	W	Q	L	R	L	Q	F	P	Q	L	N	L	D	N	L	I	P	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?																												?																			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	T	A	N	G	E	N	G	A	A	Q	Q	G	Q	S	Q	S	T	L	P	R	P	V	I	S	S	R	I	D	E	P	A	Y	Q	G	L	Q	G	F	T	A	D	I	L	L	Q	A	S	N	V	R	W	R	G	M	N	F	T	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	T	Q	M	T	N	K	S	G	L	L	E	I	T	Q	L	Q	G	K	L	N	G	G	Q	V	S	L	P	G	T	L	D	A	T	S	I	N	P	R	I	N	F	Q	P	R	L	E	N	V	E	I	G	T	I	L	K	A	F	N	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?			?		?																					?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	I	S	L	T	G	K	M	S	L	A	G	D	F	S	G	A	D	I	D	A	D	A	F	R	H	N	W	Q	G	Q	A	H	V	E	M	T	D	T	R	M	E	G	M	N	F	Q	Q	M	I	Q	Q	A	V	E	R	N	G	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																	?						?																												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	K	A	A	E	N	F	D	N	V	T	R	L	D	R	F	T	T	D	L	T	L	K	D	G	V	V	T	L	N	D	M	Q	G	Q	S	P	V	L	A	L	T	G	E	G	M	L	N	L	A	D	Q	T	C	D	T	Q	F	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																						?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		R	V	V	G	G	W	N	G	E	S	K	L	I	D	F	L	K	E	T	P	V	P	L	R	V	Y	G	N	W	Q	Q	L	N	Y	S	L	Q	V	D	Q	L	L	R	K	H	L	Q	D	E	A	K	R	R	L	N	D	W	A	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		N	K	D	S	R	N	G	K	D	V	K	K	L	L	E	K	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?								?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand