Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P14294 Date Thu Jan 5 11:33:58 GMT 2012 Unique Job ID 2c438031f6db000e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	L	F	I	A	E	K	P	S	L	A	R	A	I	A	D	V	L	P	K	P	H	R	K	G	D	G	F	I	E	C	G	N	G	Q	V	V	T	W	C	I	G	H	L	L	E	Q	A	Q	P	D	A	Y	D	S	R	Y	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																				?	?	?	?		?																									?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	N	L	A	D	L	P	I	V	P	E	K	W	Q	L	Q	P	R	P	S	V	T	K	Q	L	N	V	I	K	R	F	L	H	E	A	S	E	I	V	H	A	G	D	P	D	R	E	G	Q	L	L	V	D	E	V	L	D	Y	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	A	P	E	K	R	Q	Q	V	Q	R	C	L	I	N	D	L	N	P	Q	A	V	E	R	A	I	D	R	L	R	S	N	S	E	F	V	P	L	C	V	S	A	L	A	R	A	R	A	D	W	L	Y	G	I	N	M	T	R	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	I	L	G	R	N	A	G	Y	Q	G	V	L	S	V	G	R	V	Q	T	P	V	L	G	L	V	V	R	R	D	E	E	I	E	N	F	V	A	K	D	F	F	E	V	K	A	H	I	V	T	P	A	D	E	R	F	T	A	I	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?		?			?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	P	S	E	A	C	E	P	Y	Q	D	E	E	G	R	L	L	H	R	P	L	A	E	H	V	V	N	R	I	S	G	Q	P	A	I	V	T	S	Y	N	D	K	R	E	S	E	S	A	P	L	P	F	S	L	S	A	L	Q	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?																										?									?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	A	K	R	F	G	L	S	A	Q	N	V	L	D	I	C	Q	K	L	Y	E	T	H	K	L	I	T	Y	P	R	S	D	C	R	Y	L	P	E	E	H	F	A	G	R	H	A	V	M	N	A	I	S	V	H	A	P	D	L	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	P	V	V	D	P	D	I	R	N	R	C	W	D	D	K	K	V	D	A	H	H	A	I	I	P	T	A	R	S	S	A	I	N	L	T	E	N	E	A	K	V	Y	N	L	I	A	R	Q	Y	L	M	Q	F	C	P	D	A	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	K	C	V	I	E	L	D	I	A	K	G	K	F	V	A	K	A	R	F	L	A	E	A	G	W	R	T	L	L	G	S	K	E	R	D	E	E	N	D	G	T	P	L	P	V	V	A	K	G	D	E	L	L	C	E	K	G	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	E	R	Q	T	Q	P	P	R	H	F	T	D	A	T	L	L	S	A	M	T	G	I	A	R	F	V	Q	D	K	D	L	K	K	I	L	R	A	T	D	G	L	G	T	E	A	T	R	A	G	I	I	E	L	L	F	K	R	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?																																?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	T	K	K	G	R	Y	I	H	S	T	D	A	G	K	A	L	F	H	S	L	P	E	M	A	T	R	P	D	M	T	A	H	W	E	S	V	L	T	Q	I	S	E	K	Q	C	R	Y	Q	D	F	M	Q	P	L	V	G	T	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.
Sequence		Q	L	I	D	Q	A	K	R	T	P	V	R	Q	F	R	G	I	V	A	P	G	S	G	G	S	A	D	K	K	K	A	A	P	R	K	R	S	A	K	K	S	P	P	A	D	E	V	G	S	G	A	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand