Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32154 Date Thu Jan 5 11:49:34 GMT 2012 Unique Job ID 2bbb4de25709d3a5

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	S	S	L	R	I	V	A	I	T	N	C	P	A	G	I	A	H	T	Y	M	V	A	E	A	L	E	Q	K	A	R	S	L	G	H	T	I	K	V	E	T	Q	G	S	S	G	V	E	N	R	L	S	S	E	E	I	A	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																									?		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	Y	V	I	L	A	T	G	R	G	L	S	G	D	D	R	A	R	F	A	G	K	K	V	Y	E	I	A	I	S	Q	A	L	K	N	I	D	Q	I	F	S	E	L	P	T	N	S	Q	L	F	A	A	D	S	G	V	K	L	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	E	V	Q	S	G	S	V	M	S	H	L	M	A	G	V	S	A	A	L	P	F	V	I	G	G	G	I	L	V	A	L	A	N	M	L	V	Q	F	G	L	P	Y	T	D	M	S	K	G	A	P	S	F	T	W	V	V	E	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?																																					?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	Y	L	G	F	T	F	M	I	P	I	M	G	A	Y	I	A	S	S	I	A	D	K	P	A	F	A	P	A	F	L	V	C	Y	L	A	N	D	K	A	L	L	G	T	Q	S	G	A	G	F	L	G	A	V	V	L	G	L	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?															?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	Y	F	V	F	W	F	R	K	V	R	L	G	K	A	L	Q	P	L	L	G	S	M	L	I	P	F	V	T	L	L	V	F	G	V	L	T	Y	Y	V	I	G	P	V	M	S	D	L	M	G	G	L	L	H	F	L	N	T	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	S	M	K	F	A	A	A	F	L	V	G	A	M	L	A	F	D	M	G	G	P	I	N	K	T	A	W	F	F	C	F	S	L	L	E	K	H	I	Y	D	W	Y	A	I	V	G	V	V	A	L	M	P	P	V	A	A	G	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	F	I	A	P	K	L	F	T	R	Q	E	K	E	A	A	S	S	A	I	V	V	G	A	T	V	A	T	E	P	A	I	P	Y	A	L	A	A	P	L	P	M	I	T	A	N	T	L	A	G	G	I	T	G	V	L	V	I	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	I	K	R	L	A	P	G	L	G	I	F	D	P	L	I	G	L	M	S	P	V	G	S	F	Y	L	V	L	A	I	G	L	A	L	N	I	S	F	I	I	V	L	K	G	L	W	L	R	R	K	A	K	A	A	Q	Q	E	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?		?	?							?	?																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		H	E	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand