Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P09323 Date Thu Jan 5 11:02:10 GMT 2012 Unique Job ID 2a9618f9a83e0693

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	I	L	G	F	F	Q	R	L	G	R	A	L	Q	L	P	I	A	V	L	P	V	A	A	L	L	L	R	F	G	Q	P	D	L	L	N	V	A	F	I	A	Q	A	G	G	A	I	F	D	N	L	A	L	I	F	A	I	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	S	S	W	S	K	D	S	A	G	A	A	A	L	A	G	A	V	G	Y	F	V	L	T	K	A	M	V	T	I	N	P	E	I	N	M	G	V	L	A	G	I	I	T	G	L	V	G	G	A	A	Y	N	R	W	S	D	I	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	D	F	L	S	F	F	G	G	K	R	F	V	P	I	A	T	G	F	F	C	L	V	L	A	A	I	F	G	Y	V	W	P	P	V	Q	H	A	I	H	A	G	G	E	W	I	V	S	A	G	A	L	G	S	G	I	F	G	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	R	L	L	I	P	T	G	L	H	Q	V	L	N	T	I	A	W	F	Q	I	G	E	F	T	N	A	A	G	T	V	F	H	G	D	I	N	R	F	Y	A	G	D	G	T	A	G	M	F	M	S	G	F	F	P	I	M	M	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	P	G	A	A	L	A	M	Y	F	A	A	P	K	E	R	R	P	M	V	G	G	M	L	L	S	V	A	V	T	A	F	L	T	G	V	T	E	P	L	E	F	L	F	M	F	L	A	P	L	L	Y	L	L	H	A	L	L	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	S	L	F	V	A	T	L	L	G	I	H	A	G	F	S	F	S	A	G	A	I	D	Y	A	L	M	Y	N	L	P	A	A	S	Q	N	V	W	M	L	L	V	M	G	V	I	F	F	A	I	Y	F	V	V	F	S	L	V	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	F	N	L	K	T	P	G	R	E	D	K	E	D	E	I	V	T	E	E	A	N	S	N	T	E	E	G	L	T	Q	L	A	T	N	Y	I	A	A	V	G	G	T	D	N	L	K	A	I	D	A	C	I	T	R	L	R	L	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	D	S	A	R	V	N	D	T	M	C	K	R	L	G	A	S	G	V	V	K	L	N	K	Q	T	I	Q	V	I	V	G	A	K	A	E	S	I	G	D	A	M	K	K	V	V	A	R	G	P	V	A	A	A	S	A	E	A	T	P
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
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Sequence		A	T	A	A	P	V	A	K	P	Q	A	V	P	N	A	V	S	I	A	E	L	V	S	P	I	T	G	D	V	V	A	L	D	Q	V	P	D	E	A	F	A	S	K	A	V	G	D	G	V	A	V	K	P	T	D	K	I	V	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	A	A	G	T	I	V	K	I	F	N	T	N	H	A	F	C	L	E	T	E	K	G	A	E	I	V	V	H	M	G	I	D	T	V	A	L	E	G	K	G	F	K	R	L	V	E	E	G	A	Q	V	S	A	G	Q	P	I	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		M	D	L	D	Y	L	N	A	N	A	R	S	M	I	S	P	V	V	C	S	N	I	D	D	F	S	G	L	I	I	K	A	Q	G	H	I	V	A	G	Q	T	P	L	Y	E	I	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?						?	?	?	?	?	?	?											?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand