Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P36554 Date Thu Jan 5 11:53:15 GMT 2012 Unique Job ID 2a60cca57c649051

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	D	L	P	D	S	T	R	W	Q	L	W	I	V	A	F	G	F	F	M	Q	S	L	D	T	T	I	V	N	T	A	L	P	S	M	A	Q	S	L	G	E	S	P	L	H	M	H	M	V	I	V	S	Y	V	L	T	V	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	L	P	A	S	G	W	L	A	D	K	V	G	V	R	N	I	F	F	T	A	I	V	L	F	T	L	G	S	L	F	C	A	L	S	G	T	L	N	E	L	L	L	A	R	A	L	Q	G	V	G	G	A	M	M	V	P	V	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	T	V	M	K	I	V	P	R	E	Q	Y	M	A	A	M	T	F	V	T	L	P	G	Q	V	G	P	L	L	G	P	A	L	G	G	L	L	V	E	Y	A	S	W	H	W	I	F	L	I	N	I	P	V	G	I	I	G	A	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	L	L	L	M	P	N	Y	T	M	Q	T	R	R	F	D	L	S	G	F	L	L	L	A	V	G	M	A	V	L	T	L	A	L	D	G	S	K	G	T	G	L	S	P	L	T	I	A	G	L	V	A	V	G	V	V	A	L	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	L	L	H	A	R	N	N	N	R	A	L	F	S	L	K	L	F	R	T	R	T	F	S	L	G	L	A	G	S	F	A	G	R	I	G	S	G	M	L	P	F	M	T	P	V	F	L	Q	I	G	L	G	F	S	P	F	H	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	M	M	I	P	M	V	L	G	S	M	G	M	K	R	I	V	V	Q	V	V	N	R	F	G	Y	R	R	V	L	V	A	T	T	L	G	L	S	L	V	T	L	L	F	M	T	T	A	L	L	G	W	Y	Y	V	L	P	F	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	L	Q	G	M	V	N	S	T	R	F	S	S	M	N	T	L	T	L	K	D	L	P	D	N	L	A	S	S	G	N	S	L	L	S	M	I	M	Q	L	S	M	S	I	G	V	T	I	A	G	L	L	L	G	L	F	G	S	Q	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?				?	?	?																											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Sequence		V	S	V	D	S	G	T	T	Q	T	V	F	M	Y	T	W	L	S	M	A	L	I	I	A	L	P	A	F	I	F	A	R	V	P	N	D	T	H	Q	N	V	A	I	S	R	R	K	R	S	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																								?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand