Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P30744 Date Thu Jan 5 11:46:19 GMT 2012 Unique Job ID 2a2a5520d19e26d9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	S	V	F	D	I	F	K	I	G	I	G	P	S	S	S	H	T	V	G	P	M	K	A	G	K	Q	F	T	D	D	L	I	A	R	N	L	L	K	D	V	T	R	V	V	V	D	V	Y	G	S	L	S	L	T	G	K	G	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?			?																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	T	D	I	A	I	I	M	G	L	A	G	N	L	P	D	T	V	D	I	D	S	I	P	S	F	I	Q	D	V	N	T	H	G	R	L	M	L	A	N	G	Q	H	E	V	E	F	P	V	D	Q	C	M	N	F	H	A	D	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?					?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	L	H	E	N	G	M	R	I	T	A	L	A	G	D	K	V	V	Y	S	Q	T	Y	Y	S	I	G	G	G	F	I	V	D	E	E	H	F	G	Q	Q	D	S	A	P	V	E	V	P	Y	P	Y	S	S	A	A	D	L	Q	K	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		C	Q	E	T	G	L	S	L	S	G	L	M	M	K	N	E	L	A	L	H	S	K	E	E	L	E	Q	H	L	A	N	V	W	E	V	M	R	G	G	I	E	R	G	I	S	T	E	G	V	L	P	G	K	L	R	V	P	R	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?		?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	A	L	R	R	M	L	V	S	Q	D	K	T	T	T	D	P	M	A	V	V	D	W	I	N	M	F	A	L	A	V	N	E	E	N	A	A	G	G	R	V	V	T	A	P	T	N	G	A	C	G	I	I	P	A	V	L	A	Y	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	K	F	I	R	E	V	N	A	N	S	L	A	R	Y	L	L	V	A	S	A	I	G	S	L	Y	K	M	N	A	S	I	S	G	A	E	V	G	C	Q	G	E	V	G	V	A	C	S	M	A	A	A	G	L	A	E	L	L	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	P	A	Q	V	C	I	A	A	E	I	A	M	E	H	N	L	G	L	T	C	D	P	V	A	G	Q	V	Q	V	P	C	I	E	R	N	A	I	A	A	V	K	A	V	N	A	A	R	M	A	L	R	R	T	S	E	P	R	V	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Sequence		L	D	K	V	I	E	T	M	Y	E	T	G	K	D	M	N	A	K	Y	R	E	T	S	R	G	G	L	A	M	K	I	V	A	C	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand