Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32704 Date Thu Jan 5 11:50:25 GMT 2012 Unique Job ID 29b67f04acafc737

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	Y	N	G	L	N	N	M	F	F	P	L	C	L	I	N	D	N	H	S	V	T	S	P	S	H	T	K	K	T	K	S	D	N	Y	S	K	H	H	K	N	T	L	I	D	N	K	A	L	S	L	F	K	M	D	D	H	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	I	G	L	I	Q	K	M	K	R	I	Y	D	S	L	P	S	G	K	I	T	K	E	T	D	R	K	I	H	K	Y	F	I	D	I	A	S	H	A	N	N	K	C	D	D	R	I	T	R	R	V	Y	L	N	K	D	K	E	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?			?																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	K	V	V	Y	F	I	N	N	V	T	V	H	N	N	T	I	E	I	P	Q	T	V	N	G	G	Y	D	F	S	H	L	S	L	K	G	I	V	I	K	D	E	D	L	S	N	S	N	F	A	G	C	R	L	Q	N	A	I	F	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	C	N	M	Y	K	T	N	F	N	F	A	I	M	E	K	I	L	F	D	N	C	I	L	D	D	S	N	F	A	Q	I	K	M	T	D	G	T	L	N	S	C	S	A	M	H	V	Q	F	Y	N	A	T	M	N	R	A	N	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	T	F	L	D	Y	S	N	F	Y	M	A	Y	M	A	E	V	N	L	Y	K	V	I	A	P	Y	I	N	L	F	R	A	D	L	S	F	S	K	L	D	L	I	N	F	E	H	A	D	L	S	R	V	N	L	N	K	A	T	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	I	N	L	I	D	S	K	L	F	F	T	R	L	T	N	T	F	L	E	M	V	I	C	T	D	S	N	M	A	N	V	N	F	N	N	A	N	L	S	N	C	H	F	N	C	S	V	L	T	K	A	W	M	F	N	I	R	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	V	N	F	D	E	A	S	V	Q	G	M	G	I	T	I	L	R	G	E	E	N	I	S	I	N	S	D	I	L	V	T	L	Q	K	F	F	E	E	D	C	A	T	H	T	G	M	S	Q	T	E	D	N	L	H	A	V	A	M	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
Sequence		I	T	A	D	I	M	Q	D	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand