Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P52143 Date Wed Jan 25 15:20:58 GMT 2012 Unique Job ID 294182ceab3e8127

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	R	T	S	P	Y	Y	C	R	R	S	V	L	S	L	L	I	S	A	L	I	Y	A	P	P	G	M	A	A	F	T	T	N	V	I	G	V	V	N	D	E	T	V	D	G	N	Q	K	V	D	E	R	G	T	T	N	N	T	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?		?		?	?		?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	I	N	H	G	Q	Q	N	V	H	G	G	V	S	N	G	S	L	I	E	S	G	G	Y	Q	D	I	G	S	H	N	N	F	V	G	Q	A	N	N	T	T	I	N	G	G	R	Q	S	I	H	D	G	G	I	S	T	G	T	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?				?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?				?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	S	G	N	Q	D	V	Y	K	G	G	I	S	N	G	T	T	I	K	G	G	A	S	R	V	E	G	G	S	A	N	G	I	L	I	D	G	G	S	Q	I	V	K	V	Q	G	H	A	D	G	T	T	I	N	K	S	G	S	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?			?				?	?									?																?	?				?	?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	V	Q	G	S	L	A	T	N	T	T	I	N	G	G	R	Q	Y	V	E	Q	S	T	V	E	T	T	T	I	K	N	G	G	E	Q	R	V	Y	E	S	R	A	L	D	T	T	I	E	G	G	T	Q	S	L	N	S	K	S	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?		?	?	?	?							?	?				?			?	?	?								?	?	?		?	?	?	?	?	?	?											?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	N	T	H	I	Y	S	G	G	T	Q	I	V	D	N	T	S	T	S	D	V	I	E	V	Y	S	G	G	V	L	D	V	R	G	G	T	A	T	N	V	T	Q	H	D	G	A	I	L	K	T	N	T	N	G	T	T	V	S	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?							?	?	?			?	?				?	?													?					?	?								?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	S	E	G	A	F	S	I	H	N	H	V	A	D	N	V	L	L	E	N	G	G	H	L	D	I	N	A	Y	G	S	A	N	K	T	I	I	K	D	K	G	T	M	S	V	L	T	N	A	K	A	D	A	T	R	I	D	N	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?										?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	M	D	V	A	G	N	A	T	N	T	I	I	N	G	G	T	Q	N	I	N	N	Y	G	I	A	T	G	T	N	I	N	S	G	T	Q	N	I	K	S	G	G	K	A	D	T	T	I	I	S	S	G	S	R	Q	V	V	E	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?					?	?																	?	?	?												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	T	A	I	G	S	N	I	S	A	G	G	S	L	I	V	Y	T	G	G	I	A	H	G	V	N	Q	E	T	G	S	A	L	V	A	N	T	G	A	G	T	D	I	E	G	Y	N	K	L	S	H	F	T	I	T	G	G	E	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?													?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?			?						?	?	?	?					?	?	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Y	V	V	L	E	N	T	G	E	L	T	V	V	A	K	T	S	A	K	N	T	T	I	D	T	G	G	K	L	I	V	Q	K	E	A	K	T	D	S	T	R	L	N	N	G	G	V	L	E	V	Q	D	G	G	E	A	K	H	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?				?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Q	Q	S	G	G	A	L	I	A	S	T	T	S	G	T	L	I	E	G	T	N	S	Y	G	D	A	F	Y	I	R	N	S	E	A	K	N	V	V	L	E	N	A	G	S	L	T	V	V	T	G	S	R	A	V	D	T	I	I	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?				?	?			?	?	?													?	?		?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		N	G	K	M	D	V	Y	G	K	D	V	G	T	V	L	N	S	A	G	T	Q	T	I	Y	A	S	A	T	S	D	K	A	N	I	K	G	G	K	Q	T	V	Y	G	L	A	T	E	A	N	I	E	S	G	E	Q	I	V	D	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?																						?	?														?	?	?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		S	T	E	K	T	H	I	N	G	G	T	Q	T	V	Q	N	Y	G	K	A	I	N	T	D	I	V	S	G	L	Q	Q	I	M	A	N	G	T	A	E	G	S	I	I	N	G	G	S	Q	V	V	N	E	G	G	L	A	E	N	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																										?					?				?													?	?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		L	N	D	G	G	T	L	D	V	R	E	K	G	S	A	T	G	I	Q	Q	S	S	Q	G	A	L	V	A	T	T	R	A	T	R	V	T	G	T	R	A	D	G	V	A	F	S	I	E	Q	G	A	A	N	N	I	L	L	A	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?			?	?	?	?	?	?	?			?			?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		G	V	L	T	V	E	S	D	T	S	S	D	K	T	Q	V	N	M	G	G	R	E	I	V	K	T	K	A	T	A	T	G	T	T	L	T	G	G	E	Q	I	V	E	G	V	A	N	E	T	T	I	N	D	G	G	I	Q	T	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?																			?					?	?	?	?	?					?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		A	N	G	E	A	I	K	T	K	I	N	E	G	G	T	L	T	V	N	D	N	G	K	A	T	D	I	V	Q	N	S	G	A	A	L	Q	T	S	T	A	N	G	I	E	I	S	G	T	H	Q	Y	G	T	F	S	I	S	G	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?																?	?										?	?	?	?		?	?					?		?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		A	T	N	M	L	L	E	N	G	G	N	L	L	V	L	A	G	T	E	A	R	D	S	T	V	G	K	G	G	A	M	Q	N	L	G	Q	D	S	A	T	K	V	N	S	G	G	Q	Y	T	L	G	R	S	K	D	E	F	Q	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																			?		?																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		A	R	A	E	D	L	Q	V	A	G	G	T	A	I	V	Y	A	G	T	L	A	D	A	S	V	S	G	A	T	G	S	L	S	L	M	T	P	R	D	N	V	T	P	V	K	L	E	G	A	V	R	I	T	D	S	A	T	L	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?										?	?					?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		G	N	G	V	D	T	T	L	A	D	L	T	A	A	S	R	G	S	V	W	L	N	S	N	N	S	C	A	G	T	S	N	C	E	Y	R	V	N	S	L	L	L	N	D	G	D	V	Y	L	S	A	Q	T	A	A	P	A	T	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?										?	?				?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?		?		?									?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		G	I	Y	N	T	L	T	T	N	E	L	S	G	S	G	N	F	Y	L	H	T	N	V	A	G	S	R	G	D	Q	L	V	V	N	N	N	A	T	G	N	F	K	I	F	V	Q	D	T	G	V	S	P	Q	S	D	D	A	M	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?																											?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		V	K	T	G	G	G	D	A	S	F	T	L	G	N	T	G	G	F	V	D	L	G	T	Y	E	Y	V	L	K	S	D	G	N	S	N	W	N	L	T	N	D	V	K	P	N	P	D	P	I	P	N	P	K	P	D	P	K	P	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?			?																		?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		K	P	D	P	N	P	K	P	D	P	T	P	D	P	T	P	T	P	V	P	E	K	R	I	T	P	S	T	A	A	V	L	N	M	A	A	T	L	P	L	V	F	D	A	E	L	N	S	I	R	E	R	L	N	I	M	K	A	S	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?										?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		H	N	N	N	V	W	G	A	T	Y	N	T	R	N	N	V	T	T	D	A	G	A	G	F	E	Q	T	L	T	G	M	T	V	G	I	D	S	R	N	D	I	P	E	G	I	T	T	L	G	A	F	M	G	Y	S	H	S	H	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence		F	D	R	G	G	H	G	S	V	G	S	Y	S	L	G	G	Y	A	S	W	E	H	E	S	G	F	Y	L	D	G	V	V	K	L	N	R	F	K	S	N	V	A	G	K	M	S	S	G	G	A	A	N	G	S	Y	H	S	N	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?				?																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence		G	G	H	I	E	T	G	M	R	F	T	D	G	N	W	N	L	T	P	Y	A	S	L	T	G	F	T	A	D	N	P	E	Y	H	L	S	N	G	M	K	S	K	S	V	D	T	R	S	I	Y	R	E	L	G	A	T	L	S	Y	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?				?	?	?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500
Sequence		M	R	L	G	N	G	M	E	V	E	P	W	L	K	A	A	V	R	K	E	F	V	D	D	N	R	V	K	V	N	S	D	G	N	F	V	N	Y	L	S	G	R	R	G	I	Y	Q	A	G	I	K	A	S	F	S	S	T	L	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																					?				?	?	?	?	?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.
Sequence		H	L	G	V	G	Y	S	H	S	A	G	V	E	S	P	W	N	A	V	A	G	V	N	W	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?												?
Disorder confidence