Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P23849 Date Thu Jan 5 11:39:57 GMT 2012 Unique Job ID 282f31374dff2e99

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	T	S	H	V	R	V	V	T	H	M	C	G	F	L	V	W	L	Y	S	L	S	M	L	P	P	M	V	V	A	L	F	Y	K	E	K	S	L	F	V	F	F	I	T	F	V	I	F	F	C	I	G	G	G	A	W	Y	T	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	K	S	G	I	Q	L	R	T	R	D	G	F	I	I	I	V	M	F	W	I	L	F	S	V	I	S	A	F	P	L	W	I	D	S	E	L	N	L	T	F	I	D	A	L	F	E	G	V	S	G	I	T	T	T	G	A	T	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	D	V	S	S	L	P	R	A	Y	L	Y	Y	R	S	Q	L	N	F	I	G	G	L	G	V	I	V	L	A	V	A	V	L	P	L	L	G	I	G	G	A	K	L	Y	Q	S	E	M	P	G	P	F	K	D	D	K	L	T	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	A	D	T	S	R	T	L	W	I	T	Y	S	L	L	G	I	A	C	I	V	C	Y	R	L	A	G	M	P	L	F	D	A	I	C	H	G	I	S	T	V	S	L	G	G	F	S	T	H	S	E	S	I	G	Y	F	N	N	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	E	L	V	A	G	S	F	S	L	L	S	A	F	N	F	T	L	W	Y	I	V	I	S	R	K	T	I	K	P	L	I	R	D	I	E	L	R	F	F	L	L	I	A	L	G	V	I	I	V	T	S	F	Q	V	W	H	I	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	D	L	H	G	S	F	I	H	S	F	F	L	A	S	S	M	L	T	D	N	G	L	A	T	Q	D	Y	A	S	W	P	T	H	T	I	V	F	L	L	L	S	S	F	F	G	G	C	I	G	S	T	C	G	G	I	K	S	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?										?			?																	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	L	I	L	F	K	Q	S	K	H	E	I	N	Q	L	S	H	P	R	A	L	L	S	V	N	V	G	G	K	I	V	T	D	R	V	M	R	S	V	W	S	F	F	F	L	Y	T	L	F	T	V	F	F	I	L	V	L	N	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	Y	D	F	L	T	S	F	A	T	V	A	A	C	I	N	N	M	G	L	G	F	G	A	T	A	S	S	F	G	V	L	N	D	I	A	K	C	L	M	C	I	A	M	I	L	G	R	L	E	I	Y	P	V	I	I	L	F	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?		?	?																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.
Sequence		F	F	W	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand