Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32703 Date Thu Jan 5 11:50:22 GMT 2012 Unique Job ID 27ef29db561a90cd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	I	F	F	T	I	L	I	M	T	L	V	V	S	L	S	G	V	V	T	R	V	M	P	F	Q	I	P	L	P	L	M	Q	I	A	I	G	A	L	L	A	W	P	T	F	G	L	H	V	E	F	D	P	E	L	F	L	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?																																											?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	I	P	P	L	L	F	A	D	G	W	K	T	P	T	R	E	F	L	E	H	G	R	E	I	F	G	L	A	L	A	L	V	V	V	T	V	V	G	I	G	F	L	I	Y	W	V	V	P	G	I	P	L	I	P	A	F	A	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	V	L	S	P	T	D	A	V	A	L	S	G	I	V	G	E	G	R	I	P	K	K	I	M	G	I	L	Q	G	E	A	L	M	N	D	A	S	G	L	V	S	L	K	F	A	V	A	V	A	M	G	T	M	I	F	T	V	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	T	V	E	F	M	K	V	A	I	G	G	I	L	A	G	F	V	V	S	W	L	Y	G	R	S	L	R	F	L	S	R	W	G	G	D	E	P	A	T	Q	I	V	L	L	F	L	L	P	F	A	S	Y	L	I	A	E	H	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	S	G	I	L	A	A	V	A	A	G	M	T	I	T	R	S	G	V	M	R	R	A	P	L	A	M	R	L	R	A	N	S	T	W	A	M	L	E	F	V	F	N	G	M	V	F	L	L	L	G	L	Q	L	P	G	I	L	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	L	M	A	A	E	I	D	P	N	V	E	I	W	M	L	F	T	N	I	I	L	I	Y	A	A	L	M	L	V	R	F	G	W	L	W	T	M	K	K	F	S	N	R	F	L	K	K	K	P	M	E	F	G	S	W	T	T	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	L	I	A	S	F	A	G	V	R	G	A	I	T	L	A	G	V	L	S	I	P	L	L	L	P	D	G	N	V	F	P	A	R	Y	E	L	V	F	L	A	A	G	V	I	L	F	S	L	F	V	G	V	V	M	L	P	I	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Q	H	I	E	V	A	D	H	S	Q	Q	L	K	E	E	R	I	A	R	A	A	T	A	E	V	A	I	V	A	I	Q	K	M	E	E	R	L	A	A	D	T	E	E	N	I	D	N	Q	L	L	T	E	V	S	S	R	V	I	G	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	R	R	R	A	D	G	R	N	D	V	E	S	S	V	Q	E	E	N	L	E	R	R	F	R	L	A	A	L	R	S	E	R	A	E	L	Y	H	L	R	A	T	R	E	I	S	N	E	T	L	Q	K	L	L	H	D	L	D	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																										?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		E	A	L	L	I	E	E	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand