Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AD03 Date Thu Jan 5 11:19:33 GMT 2012 Unique Job ID 27829163bd5e48f3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	L	N	T	P	Q	I	T	P	T	K	K	I	T	V	R	A	I	G	E	E	L	P	R	G	D	Y	Q	R	C	P	Q	C	D	M	L	F	S	L	P	E	I	N	S	H	Q	S	A	Y	C	P	R	C	Q	A	K	I	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?																		?	?	?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	R	D	W	S	L	T	R	L	A	A	M	A	F	T	M	L	L	L	M	P	F	A	W	G	E	P	L	L	H	I	W	L	L	G	I	R	I	D	A	N	V	M	Q	G	I	W	Q	M	T	K	Q	G	D	A	I	T	G	S	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	F	F	C	V	I	G	A	P	L	I	L	V	T	S	I	A	Y	L	W	F	G	N	R	L	G	M	N	L	R	P	V	L	L	M	L	E	R	L	K	E	W	V	M	L	D	I	Y	L	V	G	I	G	V	A	S	I	K	V	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	Y	A	H	I	Q	A	G	V	G	L	F	S	F	V	A	L	V	I	L	T	T	V	T	L	S	H	L	N	V	E	E	L	W	E	R	F	Y	P	Q	R	P	A	T	R	R	D	E	K	L	R	V	C	L	G	C	H	F	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?																																				?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	P	D	Q	R	G	R	C	P	R	C	H	I	P	L	R	L	R	R	R	H	S	L	Q	K	C	W	A	A	L	L	A	S	I	V	L	L	L	P	A	N	L	L	P	I	S	I	I	Y	L	N	G	G	R	Q	E	D	T	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																																	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	G	I	M	S	L	A	S	S	N	I	A	V	A	G	I	V	F	I	A	S	I	L	V	P	F	T	K	V	I	V	M	F	T	L	L	L	S	I	H	F	K	C	Q	Q	G	L	R	T	R	I	L	L	L	R	M	V	T	W	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	R	W	S	M	L	D	L	F	V	I	S	L	T	M	S	L	I	N	R	D	Q	I	L	A	F	T	M	G	P	A	A	F	Y	F	G	A	A	V	I	L	T	I	L	A	V	E	W	L	D	S	R	L	L	W	D	A	H	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	N	A	R	F	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand