Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P30844 Date Thu Jan 5 11:46:28 GMT 2012 Unique Job ID 26fff8678cae7d35

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	H	F	L	R	R	P	I	S	L	R	Q	R	L	I	L	T	I	G	A	I	L	L	V	F	E	L	I	S	V	F	W	L	W	H	E	S	T	E	Q	I	Q	L	F	E	Q	A	L	R	D	N	R	N	N	D	R	H	I	M	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?							?	?	?		?	?		?	?	?	?			?																				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	I	R	E	A	V	A	S	L	I	V	P	G	V	F	M	V	S	L	T	L	F	I	C	Y	Q	A	V	R	R	I	T	R	P	L	A	E	L	Q	K	E	L	E	A	R	T	A	D	N	L	T	P	I	A	I	H	S	A	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	I	E	A	V	V	S	A	L	N	D	L	V	S	R	L	T	S	T	L	D	N	E	R	L	F	T	A	D	V	A	H	E	L	R	T	P	L	A	G	V	R	L	H	L	E	L	L	A	K	T	H	H	I	D	V	A	P	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	R	L	D	Q	M	M	E	S	V	S	Q	L	L	Q	L	A	R	A	G	Q	S	F	S	S	G	N	Y	Q	H	V	K	L	L	E	D	V	I	L	P	S	Y	D	E	L	S	T	M	L	D	Q	R	Q	Q	T	L	L	L	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	A	A	D	I	T	V	Q	G	D	A	T	L	L	R	M	L	L	R	N	L	V	E	N	A	H	R	Y	S	P	Q	G	S	N	I	M	I	K	L	Q	E	D	D	G	A	V	M	A	V	E	D	E	G	P	G	I	D	E	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		C	G	E	L	S	K	A	F	V	R	M	D	S	R	Y	G	G	I	G	L	G	L	S	I	V	S	R	I	T	Q	L	H	H	G	Q	F	F	L	Q	N	R	Q	E	T	S	G	T	R	A	W	V	R	L	K	K	D	Q	Y	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?																							?	?												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		N	Q	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand