Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P09130 Date Thu Jan 5 11:01:56 GMT 2012 Unique Job ID 263ae4aff03f7e58

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	F	N	A	K	D	M	T	Q	G	G	Q	I	A	S	M	R	I	R	M	F	S	Q	I	A	N	I	M	L	Y	C	L	F	I	F	F	W	I	L	V	G	L	V	L	W	I	K	I	S	W	Q	T	F	V	N	G	C	I	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	W	C	T	T	L	E	G	M	R	D	L	I	K	S	Q	P	V	Y	E	I	Q	Y	Y	G	K	T	F	R	M	N	A	A	Q	V	L	H	D	K	Y	M	I	W	C	S	E	Q	L	W	S	A	F	V	L	A	A	V	V	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	I	C	L	I	T	F	F	V	V	S	W	I	L	G	R	Q	G	K	Q	Q	S	E	N	E	V	T	G	G	R	Q	L	T	D	N	P	K	D	V	A	R	M	L	K	K	D	G	K	D	S	D	I	R	I	G	D	L	P	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?	?										?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	D	S	E	I	Q	N	F	C	L	H	G	T	V	G	A	G	K	S	E	V	I	R	R	L	A	N	Y	A	R	Q	R	G	D	M	V	V	I	Y	D	R	S	G	E	F	V	K	S	Y	Y	D	P	S	I	D	K	I	L	N	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	D	A	R	C	A	A	W	D	L	W	K	E	C	L	T	Q	P	D	F	D	N	T	A	N	T	L	I	P	M	G	T	K	E	D	P	F	W	Q	G	S	G	R	T	I	F	A	E	A	A	Y	L	M	R	N	D	P	N	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	S	K	L	V	D	T	L	L	S	I	K	I	E	K	L	R	T	Y	L	R	N	S	P	A	A	N	L	V	E	E	K	I	E	K	T	A	I	S	I	R	A	V	L	T	N	Y	V	K	A	I	R	Y	L	Q	G	I	E	H	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?					?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	E	P	F	T	I	R	D	W	M	R	G	V	R	E	D	Q	K	N	G	W	L	F	I	S	S	N	A	D	T	H	A	S	L	K	P	V	I	S	M	W	L	S	I	A	I	R	G	L	L	A	M	G	E	N	R	N	R	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?									?	?	?		?													?	?		?																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		W	F	F	C	D	E	L	P	T	L	H	K	L	P	D	L	V	E	I	L	P	E	A	R	K	F	G	G	C	Y	V	F	G	I	Q	S	Y	A	Q	L	E	D	I	Y	G	E	K	A	A	A	S	L	F	D	V	M	N	T	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		F	F	R	S	P	S	H	K	I	A	E	F	A	A	G	E	I	G	E	K	E	H	L	K	A	S	E	Q	Y	S	Y	G	A	D	P	V	R	D	G	V	S	T	G	K	D	M	E	R	Q	T	L	V	S	Y	S	D	I	Q	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	D	L	T	C	Y	V	T	L	P	G	P	Y	P	A	V	K	L	S	L	K	Y	Q	T	R	P	K	V	A	P	E	F	I	P	R	D	I	N	P	E	M	E	N	R	L	S	A	V	L	A	A	R	E	A	E	G	R	Q	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?	?	?	?		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		S	L	F	E	P	D	V	P	E	V	V	S	G	E	D	V	T	Q	A	E	Q	P	Q	Q	P	V	S	P	A	I	N	D	K	K	S	D	S	G	V	N	V	P	A	G	G	I	E	Q	E	L	K	M	K	P	E	E	E	M	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	L	P	P	G	I	S	E	S	G	E	V	V	D	M	A	A	Y	E	A	W	Q	Q	E	N	H	P	D	I	Q	Q	Q	M	Q	R	R	E	E	V	N	I	N	V	H	R	E	R	G	E	D	V	E	P	G	D	D	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand