Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39838 Date Thu Jan 5 12:01:06 GMT 2012 Unique Job ID 260b81bb386dc76a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	Q	K	E	T	T	A	T	T	R	F	S	L	L	P	G	S	I	T	R	F	F	L	L	L	I	I	V	L	L	V	T	M	G	V	M	V	Q	S	A	V	N	A	W	L	K	D	K	S	Y	Q	I	V	D	I	T	H	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	K	R	V	D	N	W	R	Y	V	T	W	Q	I	Y	D	N	I	A	A	T	T	S	P	S	S	G	E	G	L	Q	E	T	R	L	K	Q	D	V	Y	Y	L	E	K	P	R	R	K	T	E	A	L	I	F	G	S	H	D	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	L	E	M	T	Q	R	M	S	T	Y	L	D	T	L	W	G	A	E	N	V	P	W	S	M	Y	Y	L	N	G	Q	D	N	S	L	V	L	I	S	T	L	P	L	K	D	L	T	S	G	F	K	E	S	T	V	S	D	I	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																						?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	R	R	A	E	M	L	Q	Q	A	N	A	L	D	E	R	E	S	F	S	N	M	R	R	L	A	W	Q	N	G	H	Y	F	T	L	R	T	T	F	N	Q	P	G	H	L	A	T	V	V	A	F	D	L	P	I	N	D	L	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	G	M	P	L	D	S	F	R	L	E	P	D	A	T	A	T	G	N	N	D	N	E	K	E	G	T	D	S	V	S	I	H	F	N	S	T	K	I	E	I	S	S	A	L	N	S	T	D	M	R	L	V	W	Q	V	P	Y	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?	?					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	L	L	D	T	L	Q	N	I	L	L	P	L	L	L	N	I	G	L	L	A	L	A	L	F	G	Y	T	T	F	R	H	F	S	S	R	S	T	E	N	V	P	S	T	A	V	N	N	E	L	R	I	L	R	A	I	N	E	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	S	L	L	P	L	G	L	L	V	H	D	Q	E	S	N	R	T	V	I	S	N	K	I	A	D	H	L	L	P	H	L	N	L	Q	N	I	T	T	M	A	E	Q	H	Q	G	I	I	Q	A	T	I	N	N	E	L	Y	E	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		M	F	R	S	Q	V	A	P	R	T	Q	I	F	I	I	R	D	Q	D	R	E	V	L	V	N	K	K	L	K	Q	A	Q	R	L	Y	E	K	N	Q	Q	G	R	M	I	F	M	K	N	I	G	D	A	L	K	E	P	A	Q	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	E	S	A	A	K	L	N	A	P	E	S	K	Q	L	A	N	Q	A	D	V	L	V	R	L	V	D	E	I	Q	L	A	N	M	L	A	D	D	S	W	K	S	E	T	V	L	F	S	V	Q	D	L	I	D	E	V	V	P	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	P	A	I	K	R	K	G	L	Q	L	L	I	N	N	H	L	K	A	H	D	M	R	R	G	D	R	D	A	L	R	R	I	L	L	L	L	M	Q	Y	A	V	T	S	T	Q	L	G	K	I	T	L	E	V	D	Q	D	E	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		E	D	R	L	T	F	R	I	L	D	T	G	E	G	V	S	I	H	E	M	D	N	L	H	F	P	F	I	N	Q	T	Q	N	D	R	Y	G	K	A	D	P	L	A	F	W	L	S	D	Q	L	A	R	K	L	G	G	H	L	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																														?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		K	T	R	D	G	L	G	T	R	Y	S	V	H	I	K	M	L	A	A	D	P	E	V	E	E	E	E	E	R	L	L	D	D	V	C	V	M	V	D	V	T	S	A	E	I	R	N	I	V	T	R	Q	L	E	N	W	G	A	T	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		I	T	P	D	E	R	L	I	S	Q	D	Y	D	I	F	L	T	D	N	P	S	N	L	T	A	S	G	L	L	L	S	D	D	E	S	G	V	R	E	I	G	P	G	Q	L	C	V	N	F	N	M	S	N	A	M	Q	E	A	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		Q	L	I	E	V	Q	L	A	Q	E	E	V	T	E	S	P	L	G	G	D	E	N	A	Q	L	H	A	S	G	Y	Y	A	L	F	V	D	T	V	P	D	D	V	K	R	L	Y	T	E	A	A	T	S	D	F	A	A	L	A	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890
Sequence		A	H	R	L	K	G	V	F	A	M	L	N	L	V	P	G	K	Q	L	C	E	T	L	E	H	L	I	R	E	K	D	V	P	G	I	E	K	Y	I	S	D	I	D	S	Y	V	K	S	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?																		?	?
Disorder confidence