Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P38035 Date Thu Jan 5 11:57:48 GMT 2012 Unique Job ID 24c8e03ae0eeeaa4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	K	T	V	A	F	G	F	V	G	T	V	L	D	Y	A	G	R	G	S	Q	R	W	S	K	W	R	P	T	L	C	L	C	Q	Q	E	S	L	V	I	D	R	L	E	L	L	H	D	A	R	S	R	S	L	F	E	T	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?								?	?		?	?	?	?		?	?												?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	D	I	A	S	V	S	P	E	T	E	V	V	S	V	E	I	E	L	H	N	P	W	D	F	E	E	V	Y	A	C	L	H	D	F	A	R	G	Y	E	F	Q	P	E	K	E	D	Y	L	I	H	I	T	T	G	T	H	V	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?																												?							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	C	W	F	L	L	A	E	A	R	Y	L	P	A	R	L	I	Q	S	S	P	P	R	K	K	E	Q	P	R	G	P	G	E	V	T	I	I	D	L	D	L	S	R	Y	N	A	I	A	S	R	F	A	E	E	R	Q	Q	T	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	L	K	S	G	I	A	T	R	N	P	H	F	N	R	M	I	E	Q	I	E	K	V	A	I	K	S	R	A	P	I	L	L	N	G	P	T	G	A	G	K	S	F	L	A	R	R	I	L	E	L	K	Q	A	R	H	Q	F	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																									?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	F	V	E	V	N	C	A	T	L	R	G	D	T	A	M	S	T	L	F	G	H	V	K	G	A	F	T	G	A	R	E	S	R	E	G	L	L	R	S	A	N	G	G	M	L	F	L	D	E	I	G	E	L	G	A	D	E	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	L	L	K	A	I	E	E	K	T	F	Y	P	F	G	S	D	R	Q	V	S	S	D	F	Q	L	I	A	G	T	V	R	D	L	R	Q	L	V	A	E	G	K	F	R	E	D	L	Y	A	R	I	N	L	W	T	F	T	L	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	R	Q	R	Q	E	D	I	E	P	N	L	D	Y	E	V	E	R	H	A	S	L	T	G	D	S	V	R	F	N	T	E	A	R	R	A	W	L	A	F	A	T	S	P	Q	A	T	W	R	G	N	F	R	E	L	S	A	S	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	M	A	T	F	A	T	S	G	R	I	T	L	D	V	V	E	D	E	I	N	R	L	R	Y	N	W	Q	E	S	R	P	S	A	L	T	A	L	L	G	A	E	A	E	N	I	D	L	F	D	R	M	Q	L	E	H	V	I	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Sequence		C	R	Q	A	K	S	L	S	A	A	G	R	Q	L	F	D	V	S	R	Q	G	K	A	S	V	N	D	A	D	R	L	R	K	Y	L	A	R	F	G	L	T	W	E	A	V	Q	D	Q	H	S	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?													?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand