Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P09152 Date Thu Jan 5 11:02:00 GMT 2012 Unique Job ID 24aa65a35fa605b8

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	K	F	L	D	R	F	R	Y	F	K	Q	K	G	E	T	F	A	D	G	H	G	Q	L	L	N	T	N	R	D	W	E	D	G	Y	R	Q	R	W	Q	H	D	K	I	V	R	S	T	H	G	V	N	C	T	G	S	C	S	W
Secondary structure
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Disorder		?	?			?	?		?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	I	Y	V	K	N	G	L	V	T	W	E	T	Q	Q	T	D	Y	P	R	T	R	P	D	L	P	N	H	E	P	R	G	C	P	R	G	A	S	Y	S	W	Y	L	Y	S	A	N	R	L	K	Y	P	M	M	R	K	R	L	M	K
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SS confidence
Disorder																				?							?		?																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	W	R	E	A	K	A	L	H	S	D	P	V	E	A	W	A	S	I	I	E	D	A	D	K	A	K	S	F	K	Q	A	R	G	R	G	G	F	V	R	S	S	W	Q	E	V	N	E	L	I	A	A	S	N	V	Y	T	I	K	N
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		Y	G	P	D	R	V	A	G	F	S	P	I	P	A	M	S	M	V	S	Y	A	S	G	A	R	Y	L	S	L	I	G	G	T	C	L	S	F	Y	D	W	Y	C	D	L	P	P	A	S	P	Q	T	W	G	E	Q	T	D	V	P	E
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	A	D	W	Y	N	S	S	Y	I	I	A	W	G	S	N	V	P	Q	T	R	T	P	D	A	H	F	F	T	E	V	R	Y	K	G	T	K	T	V	A	V	T	P	D	Y	A	E	I	A	K	L	C	D	L	W	L	A	P	K	Q
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Disorder
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Sequence		G	T	D	A	A	M	A	L	A	M	G	H	V	M	L	R	E	F	H	L	D	N	P	S	Q	Y	F	T	D	Y	V	R	R	Y	T	D	M	P	M	L	V	M	L	E	E	R	D	G	Y	Y	A	A	G	R	M	L	R	A	A	D
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	V	D	A	L	G	Q	E	N	N	P	E	W	K	T	V	A	F	N	T	N	G	E	M	V	A	P	N	G	S	I	G	F	R	W	G	E	K	G	K	W	N	L	E	Q	R	D	G	K	T	G	E	E	T	E	L	Q	L	S	L
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	G	S	Q	D	E	I	A	E	V	G	F	P	Y	F	G	G	D	G	T	E	H	F	N	K	V	E	L	E	N	V	L	L	H	K	L	P	V	K	R	L	Q	L	A	D	G	S	T	A	L	V	T	T	V	Y	D	L	T	L	A
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Sequence		N	Y	G	L	E	R	G	L	N	D	V	N	C	A	T	S	Y	D	D	V	K	A	Y	T	P	A	W	A	E	Q	I	T	G	V	S	R	S	Q	I	I	R	I	A	R	E	F	A	D	N	A	D	K	T	H	G	R	S	M	I	I
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	G	A	G	L	N	H	W	Y	H	L	D	M	N	Y	R	G	L	I	N	M	L	I	F	C	G	C	V	G	Q	S	G	G	G	W	A	H	Y	V	G	Q	E	K	L	R	P	Q	T	G	W	Q	P	L	A	F	A	L	D	W	Q
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Disorder																																									?				?		?	?		?	?					?		?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		R	P	A	R	H	M	N	S	T	S	Y	F	Y	N	H	S	S	Q	W	R	Y	E	T	V	T	A	E	E	L	L	S	P	M	A	D	K	S	R	Y	T	G	H	L	I	D	F	N	V	R	A	E	R	M	G	W	L	P	S	A	P
Secondary structure
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Disorder																			?	?						?	?	?									?																	?						?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		Q	L	G	T	N	P	L	T	I	A	G	E	A	E	K	A	G	M	N	P	V	D	Y	T	V	K	S	L	K	E	G	S	I	R	F	A	A	E	Q	P	E	N	G	K	N	H	P	R	N	L	F	I	W	R	S	N	L	L	G	S
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?			?		?		?	?	?	?			?	?		?																					?												?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		S	G	K	G	H	E	F	M	L	K	Y	L	L	G	T	E	H	G	I	Q	G	K	D	L	G	Q	Q	G	G	V	K	P	E	E	V	D	W	Q	D	N	G	L	E	G	K	L	D	L	V	V	T	L	D	F	R	L	S	S	T	C
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Sequence		L	Y	S	D	I	I	L	P	T	A	T	W	Y	E	K	D	D	M	N	T	S	D	M	H	P	F	I	H	P	L	S	A	A	V	D	P	A	W	E	A	K	S	D	W	E	I	Y	K	A	I	A	K	K	F	S	E	V	C	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		H	L	G	K	E	T	D	I	V	T	L	P	I	Q	H	D	S	A	A	E	L	A	Q	P	L	D	V	K	D	W	K	K	G	E	C	D	L	I	P	G	K	T	A	P	H	I	M	V	V	E	R	D	Y	P	A	T	Y	E	R	F
Secondary structure
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		T	S	I	G	P	L	M	E	K	I	G	N	G	G	K	G	I	A	W	N	T	Q	S	E	M	D	L	L	R	K	L	N	Y	T	K	A	E	G	P	A	K	G	Q	P	M	L	N	T	A	I	D	A	A	E	M	I	L	T	L	A
Secondary structure
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Sequence		P	E	T	N	G	Q	V	A	V	K	A	W	A	A	L	S	E	F	T	G	R	D	H	T	H	L	A	L	N	K	E	D	E	K	I	R	F	R	D	I	Q	A	Q	P	R	K	I	I	S	S	P	T	W	S	G	L	E	D	E	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?		?																								?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		V	S	Y	N	A	G	Y	T	N	V	H	E	L	I	P	W	R	T	L	S	G	R	Q	Q	L	Y	Q	D	H	Q	W	M	R	D	F	G	E	S	L	L	V	Y	R	P	P	I	D	T	R	S	V	K	E	V	I	G	Q	K	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?		?			?																																							?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		G	N	Q	E	K	A	L	N	F	L	T	P	H	Q	K	W	G	I	H	S	T	Y	S	D	N	L	L	M	L	T	L	G	R	G	G	P	V	V	W	L	S	E	A	D	A	K	D	L	G	I	A	D	N	D	W	I	E	V	F	N
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SS confidence
Disorder		?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		S	N	G	A	L	T	A	R	A	V	V	S	Q	R	V	P	A	G	M	T	M	M	Y	H	A	Q	E	R	I	V	N	L	P	G	S	E	I	T	Q	Q	R	G	G	I	H	N	S	V	T	R	I	T	P	K	P	T	H	M	I	G
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Disorder																																	?	?	?	?	?	?														?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	Y	A	H	L	A	Y	G	F	N	Y	Y	G	T	V	G	S	N	R	D	E	F	V	V	V	R	K	M	K	N	I	D	W	L	D	G	E	G	N	D	Q	V	Q	E	S	V	K
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Disorder																																			?		?	?		?	?	?				?	?	?
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