Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76655 Date Thu Jan 5 12:25:14 GMT 2012 Unique Job ID 249b8d5f9bb9944f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	G	N	I	G	A	N	P	V	I	I	I	G	C	A	S	A	Y	A	V	E	F	N	K	D	L	I	E	A	E	D	R	E	N	V	N	L	S	Q	F	E	T	D	G	Q	L	P	V	G	K	Y	S	L	S	T	L	I	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?									?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	R	T	P	I	H	L	D	L	Q	W	V	L	I	D	N	Q	T	A	V	C	V	T	P	E	Q	L	T	L	L	G	F	T	D	E	F	I	E	K	T	Q	Q	N	L	I	D	G	C	Y	P	I	E	K	E	K	Q	I	T	T	Y
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SS confidence
Disorder				?	?	?																																?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	D	K	G	K	M	Q	L	S	I	S	A	P	Q	A	W	L	K	Y	K	D	A	N	W	T	P	P	E	L	W	N	H	G	I	A	G	A	F	L	D	Y	N	L	Y	A	S	H	Y	A	P	H	Q	G	D	N	S	Q	N	I	S
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SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?		?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	Y	G	Q	A	G	V	N	L	G	A	W	R	L	R	T	D	Y	Q	Y	D	Q	S	F	N	N	G	K	S	Q	A	T	N	L	D	F	P	R	I	Y	L	F	R	P	I	P	A	M	N	A	K	L	T	I	G	Q	Y	D	T	E
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Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	S	I	F	D	S	F	H	F	S	G	I	S	L	K	S	D	E	N	M	L	P	P	D	L	R	G	Y	A	P	Q	I	T	G	V	A	Q	T	N	A	K	V	T	V	S	Q	N	N	R	I	I	Y	Q	E	N	V	P	P	G	P
Secondary structure
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Disorder			?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?										?																							?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	A	I	T	N	L	F	N	T	L	Q	G	Q	L	D	V	K	V	E	E	E	D	G	R	V	T	Q	W	Q	V	A	S	N	S	I	P	Y	L	T	R	K	G	Q	I	R	Y	T	T	A	M	G	K	P	T	S	V	G	G	D	S
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Disorder					?	?	?	?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	Q	Q	P	F	F	W	T	G	E	F	S	W	G	W	L	N	N	V	S	L	Y	G	G	S	V	L	T	N	R	D	Y	Q	S	L	A	A	G	V	G	F	N	L	N	S	L	G	S	L	S	F	D	V	T	R	S	D	A	Q	L
Secondary structure
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Disorder		?																																						?		?																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		H	N	Q	D	K	E	T	G	Y	S	Y	R	A	N	Y	S	K	R	F	E	S	T	G	S	Q	L	T	F	A	G	Y	R	F	S	D	K	N	F	V	T	M	N	E	Y	I	N	D	T	N	H	Y	T	N	Y	Q	N	E	K	E	S
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?													?	?	?							?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Y	I	V	T	F	N	Q	Y	L	E	S	L	R	L	N	T	Y	V	S	L	A	R	N	T	Y	W	D	A	S	S	N	V	N	Y	S	L	S	L	S	R	D	F	D	I	G	P	L	K	N	V	S	T	S	L	T	F	S	R	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?									?		?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?											?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		W	E	E	D	N	Q	D	Q	L	Y	L	N	I	S	I	P	W	G	T	S	R	T	L	S	Y	G	M	Q	R	N	Q	D	N	E	I	S	H	T	A	S	W	Y	D	S	S	D	R	N	N	S	W	S	V	S	A	S	G	D	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?													?	?	?									?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		E	F	K	D	M	K	A	S	L	R	A	S	Y	Q	H	N	T	E	N	G	R	L	Y	L	S	G	T	S	Q	R	D	S	Y	Y	S	L	N	A	S	W	N	G	S	F	T	A	T	R	H	G	A	A	F	H	D	Y	S	G	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?											?	?	?										?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		D	S	R	F	M	I	D	A	D	G	T	E	D	I	P	L	N	N	K	R	A	V	T	N	R	Y	G	I	G	V	I	P	S	V	S	S	Y	I	T	T	S	L	S	V	D	T	R	N	L	P	E	N	V	D	I	E	N	S	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?							?		?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?																?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		T	T	T	L	T	E	G	A	I	G	Y	A	K	L	D	T	R	K	G	Y	Q	I	I	G	V	I	R	L	A	D	G	S	H	P	P	L	G	I	S	V	K	D	E	T	S	H	K	E	L	G	L	V	A	D	G	G	F	V	Y	L
Secondary structure
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.
Sequence		N	G	I	Q	D	D	N	K	L	A	L	R	W	G	D	K	S	C	F	I	Q	P	P	N	S	S	N	L	T	T	G	T	A	I	L	P	C	I	S	Q	N
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Disorder						?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?
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