Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75785 Date Thu Jan 5 12:14:07 GMT 2012 Unique Job ID 243b30e9e423b203

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	L	T	L	K	E	S	L	V	T	R	S	R	V	F	S	P	W	T	A	F	Y	F	L	Q	S	L	L	I	N	L	G	L	G	Y	P	F	S	L	L	Y	T	A	A	F	T	A	I	L	L	L	L	W	R	T	L	P	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	K	V	L	V	G	V	S	S	L	V	A	A	C	Y	F	P	F	A	Q	A	Y	G	A	P	N	F	N	T	L	L	A	L	H	S	T	N	M	E	E	S	T	E	I	L	T	I	F	P	W	Y	S	Y	L	V	G	L	F	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	L	G	V	I	A	I	R	R	K	K	E	N	E	K	A	R	W	N	T	F	D	S	L	C	L	V	F	S	V	A	T	F	F	V	A	P	V	Q	N	L	A	W	G	G	V	F	K	L	K	D	T	G	Y	P	V	F	R	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	D	V	I	V	N	N	N	E	V	I	E	E	Q	E	R	M	A	K	L	S	G	M	K	D	T	W	T	V	T	A	V	K	P	K	Y	Q	T	Y	V	V	V	I	G	E	S	A	R	R	D	A	L	G	A	F	G	G	H	W	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	T	P	F	A	S	S	V	N	G	L	I	F	A	D	Y	I	A	A	S	G	S	T	Q	K	S	L	G	L	T	L	N	R	V	V	D	G	K	P	Q	F	Q	D	N	F	V	T	L	A	N	R	A	G	F	Q	T	W	W	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	Q	G	Q	I	G	E	Y	D	T	A	I	A	S	I	A	K	R	A	D	E	V	Y	F	L	K	E	G	N	F	E	A	D	K	N	T	K	D	E	A	L	L	D	M	T	A	Q	V	L	A	Q	E	H	S	Q	P	Q	L	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	H	L	M	G	S	H	P	Q	A	C	D	R	T	Q	G	K	Y	E	T	F	V	Q	S	K	E	T	S	C	Y	L	Y	T	M	T	Q	T	D	D	L	L	R	K	L	Y	D	Q	L	R	N	S	G	S	S	F	S	L	V	Y	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	D	H	G	L	A	F	K	E	R	G	K	D	V	Q	Y	L	A	H	D	D	K	Y	Q	Q	N	F	Q	V	P	F	M	V	I	S	S	D	D	K	A	H	R	V	I	K	A	R	R	S	A	N	D	F	L	G	F	F	S	Q	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	G	I	K	A	K	E	I	N	I	K	Y	P	F	I	S	E	K	K	A	G	P	I	Y	I	T	N	F	Q	L	Q	K	V	D	Y	N	H	L	G	T	D	I	F	D	P	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?																																	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand