Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P21179 Date Thu Jan 5 11:38:00 GMT 2012 Unique Job ID 23f094ecbf46be35

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	Q	H	N	E	K	N	P	H	Q	H	Q	S	P	L	H	D	S	S	E	A	K	P	G	M	D	S	L	A	P	E	D	G	S	H	R	P	A	A	E	P	T	P	P	G	A	Q	P	T	A	P	G	S	L	K	A	P	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	N	E	K	L	N	S	L	E	D	V	R	K	G	S	E	N	Y	A	L	T	T	N	Q	G	V	R	I	A	D	D	Q	N	S	L	R	A	G	S	R	G	P	T	L	L	E	D	F	I	L	R	E	K	I	T	H	F	D	H	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?									?	?		?	?	?																?		?	?			?																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	I	P	E	R	I	V	H	A	R	G	S	A	A	H	G	Y	F	Q	P	Y	K	S	L	S	D	I	T	K	A	D	F	L	S	D	P	N	K	I	T	P	V	F	V	R	F	S	T	V	Q	G	G	A	G	S	A	D	T	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?																																															?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	I	R	G	F	A	T	K	F	Y	T	E	E	G	I	F	D	L	V	G	N	N	T	P	I	F	F	I	Q	D	A	H	K	F	P	D	F	V	H	A	V	K	P	E	P	H	W	A	I	P	Q	G	Q	S	A	H	D	T	F	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	Y	V	S	L	Q	P	E	T	L	H	N	V	M	W	A	M	S	D	R	G	I	P	R	S	Y	R	T	M	E	G	F	G	I	H	T	F	R	L	I	N	A	E	G	K	A	T	F	V	R	F	H	W	K	P	L	A	G	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	L	V	W	D	E	A	Q	K	L	T	G	R	D	P	D	F	H	R	R	E	L	W	E	A	I	E	A	G	D	F	P	E	Y	E	L	G	F	Q	L	I	P	E	E	D	E	F	K	F	D	F	D	L	L	D	P	T	K	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?																																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	E	E	L	V	P	V	Q	R	V	G	K	M	V	L	N	R	N	P	D	N	F	F	A	E	N	E	Q	A	A	F	H	P	G	H	I	V	P	G	L	D	F	T	N	D	P	L	L	Q	G	R	L	F	S	Y	T	D	T	Q	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	R	L	G	G	P	N	F	H	E	I	P	I	N	R	P	T	C	P	Y	H	N	F	Q	R	D	G	M	H	R	M	G	I	D	T	N	P	A	N	Y	E	P	N	S	I	N	D	N	W	P	R	E	T	P	P	G	P	K	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?						?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	F	E	S	Y	Q	E	R	V	E	G	N	K	V	R	E	R	S	P	S	F	G	E	Y	Y	S	H	P	R	L	F	W	L	S	Q	T	P	F	E	Q	R	H	I	V	D	G	F	S	F	E	L	S	K	V	V	R	P	Y	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	R	V	V	D	Q	L	A	H	I	D	L	T	L	A	Q	A	V	A	K	N	L	G	I	E	L	T	D	D	Q	L	N	I	T	P	P	P	D	V	N	G	L	K	K	D	P	S	L	S	L	Y	A	I	P	D	G	D	V	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?			?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		R	V	V	A	I	L	L	N	D	E	V	R	S	A	D	L	L	A	I	L	K	A	L	K	A	K	G	V	H	A	K	L	L	Y	S	R	M	G	E	V	T	A	D	D	G	T	V	L	P	I	A	A	T	F	A	G	A	P	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?		?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		T	V	D	A	V	I	V	P	C	G	N	I	A	D	I	A	D	N	G	D	A	N	Y	Y	L	M	E	A	Y	K	H	L	K	P	I	A	L	A	G	D	A	R	K	F	K	A	T	I	K	I	A	D	Q	G	E	E	G	I	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?																								?					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.
Sequence		A	D	S	A	D	G	S	F	M	D	E	L	L	T	L	M	A	A	H	R	V	W	S	R	I	P	K	I	D	K	I	P	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand