Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P05041 Date Thu Jan 5 10:58:36 GMT 2012 Unique Job ID 22e36ecb8efed07a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	T	L	S	P	A	V	I	T	L	L	W	R	Q	D	A	A	E	F	Y	F	S	R	L	S	H	L	P	W	A	M	L	L	H	S	G	Y	A	D	H	P	Y	S	R	F	D	I	V	V	A	E	P	I	C	T	L	T	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	K	E	T	V	V	S	E	S	E	K	R	T	T	T	T	D	D	P	L	Q	V	L	Q	Q	V	L	D	R	A	D	I	R	P	T	H	N	E	D	L	P	F	Q	G	G	A	L	G	L	F	G	Y	D	L	G	R	R	F	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?																		?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	P	E	I	A	E	Q	D	I	V	L	P	D	M	A	V	G	I	Y	D	W	A	L	I	V	D	H	Q	R	H	T	V	S	L	L	S	H	N	D	V	N	A	R	R	A	W	L	E	S	Q	Q	F	S	P	Q	E	D	F	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	S	D	W	Q	S	N	M	T	R	E	Q	Y	G	E	K	F	R	Q	V	Q	E	Y	L	H	S	G	D	C	Y	Q	V	N	L	A	Q	R	F	H	A	T	Y	S	G	D	E	W	Q	A	F	L	Q	L	N	Q	A	N	R	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	S	A	F	L	R	L	E	Q	G	A	I	L	S	L	S	P	E	R	F	I	L	C	D	N	S	E	I	Q	T	R	P	I	K	G	T	L	P	R	L	P	D	P	Q	E	D	S	K	Q	A	V	K	L	A	N	S	A	K	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	E	N	L	M	I	V	D	L	M	R	N	D	I	G	R	V	A	V	A	G	S	V	K	V	P	E	L	F	V	V	E	P	F	P	A	V	H	H	L	V	S	T	I	T	A	Q	L	P	E	Q	L	H	A	S	D	L	L	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	F	P	G	G	S	I	T	G	A	P	K	V	R	A	M	E	I	I	D	E	L	E	P	Q	R	R	N	A	W	C	G	S	I	G	Y	L	S	F	C	G	N	M	D	T	S	I	T	I	R	T	L	T	A	I	N	G	Q	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Sequence		C	S	A	G	G	G	I	V	A	D	S	Q	E	E	A	E	Y	Q	E	T	F	D	K	V	N	R	I	L	K	Q	L	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand