Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32140 Date Thu Jan 5 11:49:26 GMT 2012 Unique Job ID 22afa0dfe333a0d6

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	W	F	N	T	L	S	H	N	R	W	L	E	Q	E	T	D	R	I	F	D	F	G	K	N	S	V	V	P	T	G	F	G	W	L	G	N	K	G	Q	I	K	E	E	M	G	T	H	L	W	I	T	A	R	M	L	H	V	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	V	A	A	A	M	G	R	P	G	A	Y	S	L	V	D	H	G	I	K	A	M	N	G	A	L	R	D	K	K	Y	G	G	W	Y	A	C	V	N	D	E	G	V	V	D	A	S	K	Q	G	Y	Q	H	F	F	A	L	L	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	S	A	V	T	T	G	H	P	E	A	R	K	L	L	D	Y	T	I	E	I	I	E	K	Y	F	W	S	E	E	E	Q	M	C	L	E	S	W	D	E	A	F	S	K	T	E	E	Y	R	G	G	N	A	N	M	H	A	V	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	L	I	V	Y	D	V	T	H	D	K	K	W	L	D	R	A	I	R	V	A	S	V	I	I	H	D	V	A	R	N	N	H	Y	R	V	N	E	H	F	D	T	Q	W	N	P	L	P	D	Y	N	K	D	N	P	A	H	R	F	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	F	G	G	T	P	G	H	W	I	E	W	G	R	L	M	L	H	I	H	A	A	L	E	A	R	C	E	Q	P	P	A	W	L	L	E	D	A	K	G	L	F	N	A	T	V	R	D	A	W	A	P	D	G	A	D	G	I	V	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	V	D	W	E	G	K	P	V	V	R	E	R	V	R	W	P	I	V	E	A	M	G	T	A	Y	A	L	Y	T	V	T	G	D	R	Q	Y	E	T	W	Y	Q	T	W	W	E	Y	C	I	K	Y	L	M	D	Y	E	N	G	S	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Sequence		W	Q	E	L	D	A	D	N	K	V	T	T	K	V	W	D	G	K	Q	D	I	Y	H	L	L	H	C	L	V	I	P	R	I	P	L	A	P	G	M	A	P	A	V	A	A	G	L	L	D	I	N	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?		?	?	?	?		?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand