Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76046 Date Thu Jan 5 12:17:49 GMT 2012 Unique Job ID 220dfabca227ee86

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	R	L	K	N	E	L	N	A	L	V	N	R	G	V	D	R	H	L	R	L	A	V	T	G	L	S	R	S	G	K	T	A	F	I	T	A	M	V	N	Q	L	L	N	I	H	A	G	A	R	L	P	L	L	S	A	V	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																												?		?	?									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	R	L	L	G	V	K	R	I	P	Q	R	D	F	G	I	P	R	F	T	Y	D	E	G	L	A	Q	L	Y	G	D	P	P	A	W	P	T	P	T	R	G	V	S	E	I	R	L	A	L	R	F	K	S	N	D	S	L	L	R	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?					?		?																	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	K	D	T	S	T	L	Y	L	E	I	V	D	Y	P	G	E	W	L	L	D	L	P	M	L	A	Q	D	Y	L	S	W	S	R	Q	M	T	G	L	L	N	G	Q	R	G	E	W	S	A	K	W	R	M	M	S	E	G	L	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																							?																		?														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	A	P	A	D	E	N	R	L	A	D	I	A	A	A	W	T	D	Y	L	H	H	C	K	E	Q	G	L	H	F	I	Q	P	G	R	F	V	L	P	G	D	M	A	G	A	P	A	L	Q	F	F	P	W	P	D	V	D	T	W	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																														?	?																						?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	S	K	L	A	Q	A	D	K	H	T	N	A	G	M	L	R	E	R	F	N	Y	Y	C	E	K	V	V	K	G	F	Y	K	N	H	F	L	R	F	D	R	Q	I	V	L	V	D	C	L	Q	P	L	N	S	G	P	Q	A	F	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?																																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	M	R	L	A	L	T	Q	L	M	Q	S	F	H	Y	G	Q	R	T	L	F	R	R	L	F	S	P	V	I	D	K	L	L	F	A	A	T	K	A	D	H	V	T	I	D	Q	H	A	N	M	V	S	L	L	Q	Q	L	I	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	W	Q	N	A	A	F	E	G	I	S	M	D	C	L	G	L	A	S	V	Q	A	T	T	S	G	I	I	D	V	N	G	E	K	I	P	A	L	R	G	N	R	L	S	D	G	A	P	L	T	V	Y	P	G	E	V	P	A	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Sequence		P	G	Q	A	F	W	D	K	Q	G	F	Q	F	E	A	F	R	P	Q	V	M	D	V	D	K	P	L	P	H	I	R	L	D	A	A	L	E	F	L	I	G	D	K	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand