Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ADF6 Date Thu Jan 5 11:20:54 GMT 2012 Unique Job ID 2163c7fdf50c001e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	P	Q	L	L	R	V	T	N	R	I	I	E	R	S	R	E	T	R	S	A	Y	L	A	R	I	E	Q	A	K	T	S	T	V	H	R	S	Q	L	A	C	G	N	L	A	H	G	F	A	A	C	Q	P	E	D	K	A	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?													?	?												?	?	?	?	?		?	?		?													?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	S	M	L	R	N	N	I	A	I	I	T	S	Y	N	D	M	L	S	A	H	Q	P	Y	E	H	Y	P	E	I	I	R	K	A	L	H	E	A	N	A	V	G	Q	V	A	G	G	V	P	A	M	C	D	G	V	T	Q	G	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	M	E	L	S	L	L	S	R	E	V	I	A	M	S	A	A	V	G	L	S	H	N	M	F	D	G	A	L	F	L	G	V	C	D	K	I	V	P	G	L	T	M	A	A	L	S	F	G	H	L	P	A	V	F	V	P	S	G	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	A	S	G	L	P	N	K	E	K	V	R	I	R	Q	L	Y	A	E	G	K	V	D	R	M	A	L	L	E	S	E	A	A	S	Y	H	A	P	G	T	C	T	F	Y	G	T	A	N	T	N	Q	M	V	V	E	F	M	G	M	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	P	G	S	S	F	V	H	P	D	S	P	L	R	D	A	L	T	A	A	A	A	R	Q	V	T	R	M	T	G	N	G	N	E	W	M	P	I	G	K	M	I	D	E	K	V	V	V	N	G	I	V	A	L	L	A	T	G	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?																							?	?	?									?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	N	H	T	M	H	L	V	A	M	A	R	A	A	G	I	Q	I	N	W	D	D	F	S	D	L	S	D	V	V	P	L	M	A	R	L	Y	P	N	G	P	A	D	I	N	H	F	Q	A	A	G	G	V	P	V	L	V	R	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	K	A	G	L	L	H	E	D	V	N	T	V	A	G	F	G	L	S	R	Y	T	L	E	P	W	L	N	N	G	E	L	D	W	R	E	G	A	E	K	S	L	D	S	N	V	I	A	S	F	E	Q	P	F	S	H	H	G	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?		?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	V	L	S	G	N	L	G	R	A	V	M	K	T	S	A	V	P	V	E	N	Q	V	I	E	A	P	A	V	V	F	E	S	Q	H	D	V	M	P	A	F	E	A	G	L	L	D	R	D	C	V	V	V	V	R	H	Q	G	P	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?																							?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	N	G	M	P	E	L	H	K	L	M	P	P	L	G	V	L	L	D	R	C	F	K	I	A	L	V	T	D	G	R	L	S	G	A	S	G	K	V	P	S	A	I	H	V	T	P	E	A	Y	D	G	G	L	L	A	K	V	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?	?	?	?	?	?	?	?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	D	I	I	R	V	N	G	Q	T	G	E	L	T	L	L	V	D	E	A	E	L	A	A	R	E	P	H	I	P	D	L	S	A	S	R	V	G	T	G	R	E	L	F	S	A	L	R	E	K	L	S	G	A	E	Q	G	A	T	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?		?	?	?	?	?	?	?												?	?								?
Disorder confidence
		.	.	.
Sequence		I	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand