Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AAB4 Date Thu Jan 5 11:12:26 GMT 2012 Unique Job ID 214ea8dd1d264932

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	A	M	K	Y	N	D	L	R	D	F	L	T	L	L	E	Q	Q	G	E	L	K	R	I	T	L	P	V	D	P	H	L	E	I	T	E	I	A	D	R	T	L	R	A	G	G	P	A	L	L	F	E	N	P	K	G	Y	S	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	V	L	C	N	L	F	G	T	P	K	R	V	A	M	G	M	G	Q	E	D	V	S	A	L	R	E	V	G	K	L	L	A	F	L	K	E	P	E	P	P	K	G	F	R	D	L	F	D	K	L	P	Q	F	K	Q	V	L	N	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	T	K	R	L	R	G	A	P	C	Q	Q	K	I	V	S	G	D	D	V	D	L	N	R	I	P	I	M	T	C	W	P	E	D	A	A	P	L	I	T	W	G	L	T	V	T	R	G	P	H	K	E	R	Q	N	L	G	I	Y	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	Q	L	I	G	K	N	K	L	I	M	R	W	L	S	H	R	G	G	A	L	D	Y	Q	E	W	C	A	A	H	P	G	E	R	F	P	V	S	V	A	L	G	A	D	P	A	T	I	L	G	A	V	T	P	V	P	D	T	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	Y	A	F	A	G	L	L	R	G	T	K	T	E	V	V	K	C	I	S	N	D	L	E	V	P	A	S	A	E	I	V	L	E	G	Y	I	E	Q	G	E	T	A	P	E	G	P	Y	G	D	H	T	G	Y	Y	N	E	V	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	P	V	F	T	V	T	H	I	T	Q	R	E	D	A	I	Y	H	S	T	Y	T	G	R	P	P	D	E	P	A	V	L	G	V	A	L	N	E	V	F	V	P	I	L	Q	K	Q	F	P	E	I	V	D	F	Y	L	P	P	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		C	S	Y	R	L	A	V	V	T	I	K	K	Q	Y	A	G	H	A	K	R	V	M	M	G	V	W	S	F	L	R	Q	F	M	Y	T	K	F	V	I	V	C	D	D	D	V	N	A	R	D	W	N	D	V	I	W	A	I	T	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		M	D	P	A	R	D	T	V	L	V	E	N	T	P	I	D	Y	L	D	F	A	S	P	V	S	G	L	G	S	K	M	G	L	D	A	T	N	K	W	P	G	E	T	Q	R	E	W	G	R	P	I	K	K	D	P	D	V	V	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?															?	?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	D	A	I	W	D	E	L	A	I	F	N	N	G	K	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand