Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31058 Date Thu Jan 5 11:46:54 GMT 2012 Unique Job ID 20580a8807e644f5

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	T	I	F	R	Y	I	L	F	L	A	L	Y	S	C	C	N	T	V	S	A	Y	T	S	F	I	V	G	N	N	A	G	V	D	N	Y	R	G	P	S	T	A	A	Q	M	T	F	N	Y	T	S	T	A	S	N	L	V	F	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	P	T	Q	L	G	P	T	G	V	K	M	Y	W	S	Y	L	D	T	G	T	G	G	G	I	L	Y	C	N	T	S	G	R	A	N	P	G	P	I	T	I	E	N	A	M	V	Y	S	G	K	D	Y	G	G	H	K	L	F	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?									?							?		?	?											?	?	?	?											?	?	?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	V	P	G	L	Y	Y	T	M	L	I	S	R	V	W	S	A	Y	D	T	I	T	D	I	Q	S	P	G	I	Y	I	G	D	P	S	N	Q	E	F	F	F	S	V	T	D	S	D	L	Q	T	K	G	C	N	K	A	D	D	Y	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?			?														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	F	W	A	I	G	G	I	V	H	N	I	T	V	E	F	Y	T	D	T	N	F	D	P	T	L	N	Q	Q	V	Q	L	S	S	S	S	N	Y	L	Y	S	F	K	A	Y	S	P	G	T	K	V	V	D	H	S	N	H	I	Y	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	F	T	L	N	N	V	K	L	T	L	P	T	C	F	T	S	I	L	T	G	P	S	V	N	G	S	T	V	R	M	G	E	Y	S	S	G	T	I	K	N	G	A	S	P	V	P	F	D	I	S	L	Q	N	C	I	R	V	R	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?					?		?	?					?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	E	T	K	L	V	T	G	K	V	G	T	Q	N	T	Q	L	L	G	N	T	L	T	G	S	T	A	A	K	G	V	G	V	L	I	E	G	L	A	T	S	K	N	P	L	M	T	L	K	P	N	D	T	N	S	V	Y	I	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?			?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?				?				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Sequence		E	T	E	D	D	T	S	D	G	V	Y	P	N	Q	G	N	G	T	S	Q	P	L	H	F	Q	A	T	L	K	Q	D	G	N	I	A	I	E	P	G	E	F	K	A	T	S	T	F	Q	V	T	Y	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?												?	?	?						?	?											?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand