Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37661 Date Thu Jan 5 11:56:34 GMT 2012 Unique Job ID 2032e1476e7bfd1a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	Y	I	K	S	I	T	Q	Q	K	L	S	F	L	L	A	I	Y	I	G	L	F	M	N	G	A	V	F	Y	R	R	F	G	S	Y	A	H	D	F	T	V	W	K	G	I	S	A	V	V	E	L	A	A	T	V	L	V	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	L	L	R	L	L	S	L	F	G	R	R	S	W	R	I	L	A	S	L	V	V	L	F	S	A	G	A	S	Y	Y	M	T	F	L	N	V	V	I	G	Y	G	I	I	A	S	V	M	T	T	D	I	D	L	S	K	E	V	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	N	F	I	L	W	L	I	A	V	S	A	L	P	L	I	L	I	W	N	N	R	C	R	Y	T	L	L	R	Q	L	R	T	P	G	Q	R	I	R	S	L	A	V	V	V	L	A	G	I	M	V	W	A	P	I	R	L	L	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	Q	K	K	V	E	R	A	T	G	V	D	L	P	S	Y	G	G	V	V	A	N	S	Y	L	P	S	N	W	L	S	A	L	G	L	Y	A	W	A	R	V	D	E	S	S	D	N	N	S	L	L	N	P	A	K	K	F	T	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?										?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	P	Q	N	V	D	D	T	Y	V	V	F	I	I	G	E	T	T	R	W	D	H	M	G	I	F	G	Y	E	R	N	T	T	P	K	L	A	Q	E	K	N	L	A	A	F	R	G	Y	S	C	D	T	A	T	K	L	S	L	R	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	F	V	R	Q	G	G	A	E	D	N	P	Q	R	T	L	K	E	Q	N	I	F	A	V	L	K	Q	L	G	F	S	S	D	L	Y	A	M	Q	S	E	M	W	F	Y	S	N	T	M	A	D	N	I	A	Y	R	E	Q	I	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	P	R	N	R	G	K	P	V	D	D	M	L	L	V	D	E	M	Q	Q	S	L	G	R	N	P	D	G	K	H	L	I	I	L	H	T	K	G	S	H	F	N	Y	T	Q	R	Y	P	R	S	F	A	Q	W	K	P	E	C	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?																																																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	D	S	G	C	T	K	A	Q	M	I	N	S	Y	D	N	S	V	T	Y	V	D	H	F	I	S	S	V	I	D	Q	V	R	D	K	K	A	I	V	F	Y	A	A	D	H	G	E	S	I	N	E	R	E	H	L	H	G	T	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																													?	?	?	?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	L	A	P	P	E	Q	F	R	V	P	M	M	V	W	M	S	D	K	Y	L	E	N	P	A	N	A	Q	A	F	A	Q	L	K	K	E	A	D	M	K	V	P	R	R	H	V	E	L	Y	D	T	I	M	G	C	L	G	Y	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																	?	?	?	?	?	?			?			?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Sequence		P	D	G	G	I	N	E	N	N	N	W	C	H	I	P	Q	A	K	E	A	A	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand