Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P43671 Date Thu Jan 5 12:02:24 GMT 2012 Unique Job ID 1f6fcba761d999b9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	S	N	N	G	E	A	K	I	Q	K	V	K	N	W	S	P	V	W	I	F	P	I	V	T	A	L	I	G	A	W	V	L	F	Y	H	Y	S	H	Q	G	P	E	V	T	L	I	T	A	N	A	E	G	I	E	G	G	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																					?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	I	K	S	R	S	V	D	V	G	V	V	E	S	A	T	L	A	D	D	L	T	H	V	E	I	K	A	R	L	N	S	G	M	E	K	L	L	H	K	D	T	V	F	W	V	V	K	P	Q	I	G	R	E	G	I	S	G	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?																													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	L	L	S	G	V	Y	I	E	L	Q	P	G	A	K	G	S	K	M	D	K	Y	D	L	L	D	S	P	P	L	A	P	P	D	A	K	G	I	R	V	I	L	D	S	K	K	A	G	Q	L	S	P	G	D	P	V	L	F	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?							?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?		?		?								?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	R	V	G	S	V	E	T	S	T	F	D	T	Q	K	R	N	I	S	Y	Q	L	F	I	N	A	P	Y	D	R	L	V	T	N	N	V	R	F	W	K	D	S	G	I	A	V	D	L	T	S	A	G	M	R	V	E	M	G	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																																			?	?	?	?	?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	T	L	L	S	G	G	V	S	F	D	V	P	E	G	L	D	L	G	Q	P	V	A	P	K	T	A	F	V	L	Y	D	D	Q	K	S	I	Q	D	S	L	Y	T	D	H	I	D	Y	L	M	F	F	K	D	S	V	R	G	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?		?															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	G	A	P	V	E	F	R	G	I	R	L	G	T	V	S	K	V	P	F	F	A	P	N	M	R	Q	T	F	N	D	D	Y	R	I	P	V	L	I	R	I	E	P	E	R	L	K	M	Q	L	G	E	N	A	D	V	V	E	H	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																					?	?		?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	E	L	L	K	R	G	L	R	G	S	L	K	T	G	N	L	V	T	G	A	L	Y	V	D	L	D	F	Y	P	N	T	P	A	I	T	G	I	R	E	F	N	G	Y	Q	I	I	P	T	V	S	G	G	L	A	Q	I	Q	Q	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?		?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	M	E	A	L	D	K	I	N	K	L	P	L	N	P	M	I	E	Q	A	T	S	T	L	S	E	S	Q	R	T	M	K	N	L	Q	T	T	L	D	S	M	N	K	I	L	A	S	Q	S	M	Q	Q	L	P	T	D	M	Q	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	R	E	L	N	R	S	M	Q	G	F	Q	P	G	S	A	A	Y	N	K	M	V	A	D	M	Q	R	L	D	Q	V	L	R	E	L	Q	P	V	L	K	T	L	N	E	K	S	N	A	L	V	F	E	A	K	D	K	K	D	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.
Sequence		P	K	R	A	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand