Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75908 Date Thu Jan 5 12:15:54 GMT 2012 Unique Job ID 1f6d82655f9b412d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	K	D	Y	L	R	I	S	S	T	V	L	V	S	L	L	F	G	L	A	L	V	L	V	N	S	W	F	N	Q	P	G	V	E	E	V	V	P	R	S	T	Y	L	M	V	M	I	A	L	F	F	I	D	T	V	A	F	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																									?		?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	Q	L	Y	F	I	Y	D	R	R	Q	F	S	N	C	V	L	S	L	A	F	L	S	C	L	I	Y	F	V	I	T	V	I	I	I	Q	Q	I	I	E	E	R	L	T	S	S	V	V	Q	N	D	I	A	I	Y	Y	L	F	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																																		?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	S	L	C	I	L	I	F	L	A	L	V	N	K	V	S	E	N	T	K	Q	R	N	L	F	S	K	K	M	T	L	C	I	S	L	F	F	V	F	G	G	P	I	V	A	H	I	L	S	S	H	Y	E	S	Y	N	L	H	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	L	T	N	E	N	G	Q	V	V	W	K	A	S	Y	V	T	I	M	I	F	M	W	L	T	L	L	S	V	N	L	Y	F	N	G	L	R	Y	D	I	W	N	G	V	T	V	I	A	F	C	A	V	L	Y	N	I	S	L	L	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	S	R	Y	S	V	S	T	W	Y	I	S	R	T	I	E	V	V	S	K	L	T	V	M	V	I	F	M	C	H	I	F	S	A	L	R	V	T	K	N	I	A	H	R	D	P	L	T	N	I	F	N	R	N	Y	F	F	N	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?																																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	V	Q	S	A	S	A	Q	K	T	P	Y	C	V	M	I	M	D	I	D	H	F	K	K	V	N	D	T	W	G	H	P	V	G	D	Q	V	I	K	T	V	V	N	I	I	G	K	S	I	R	P	D	D	L	L	A	R	V	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	E	F	G	V	L	L	T	D	I	D	T	E	R	A	K	A	L	A	E	R	I	R	E	N	V	E	R	L	T	G	D	N	P	E	Y	A	I	P	Q	K	V	T	I	S	I	G	A	V	V	T	Q	E	N	A	L	N	P	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Sequence		I	Y	R	L	A	D	N	A	L	Y	E	A	K	E	T	G	R	N	K	V	V	V	R	D	V	V	N	F	C	E	S	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand