![]() |
| ||||||||||||||||||||||||
|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
|   | |
| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 21 | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | A | F | M | A | N | A | A | D | V | P | Q | V | K | V | T | V | T | D | K | Q | C | E | P | M | T | I | T | V | N | A | G | K | T | Q | F | I | I | Q | N | H | S | Q | K | A | L | . | . | . | E | W | E | I | L | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | K | G | V | M | V |
| Template Sequence |   | G | M | K | P | L | E | L | P | A | P | T | V | S | V | K | V | E | D | A | T | Y | R | V | P | G | R | A | M | R | . | . | . | M | K | L | T | I | T | N | H | G | N | S | P | I | R | L | G | E | F | Y | T | A | S | V | R | F | L | D | S | D | V | Y | K | D | T | T | G | Y | P | E | D | L | L | A | E | D | G | L | S |
| Template Known Secondary structure |   | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | T | S | G | G | G | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 271 | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | |||
|   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 76 | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | V | E | E | R | E | N | I | A | P | G | F | S | Q | K | M | T | A | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | V | S | D | N | S | P | L | A | P | G | E | T | R | T | V | D | V | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | ![]() | S | S | B | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 348 | . | 350 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |
| Download: | Text version |
No model constructed - rank, confidence too low
Phyre is for academic use only
| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
|   | ||||||||
|
| |||||||