Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37689 Date Thu Jan 5 11:57:01 GMT 2012 Unique Job ID 1f372a01d8d2cf9d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	V	S	K	K	P	M	V	L	V	I	L	D	G	Y	G	Y	R	E	E	Q	Q	D	N	A	I	F	S	A	K	T	P	V	M	D	A	L	W	A	N	R	P	H	T	L	I	D	A	S	G	L	E	V	G	L	P	D	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?															?		?		?																										?			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	G	N	S	E	V	G	H	V	N	L	G	A	G	R	I	V	Y	Q	D	L	T	R	L	D	V	E	I	K	D	R	A	F	F	A	N	P	V	L	T	G	A	V	D	K	A	K	N	A	G	K	A	V	H	I	M	G	L	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	G	G	V	H	S	H	E	D	H	I	M	A	M	V	E	L	A	A	E	R	G	A	E	K	I	Y	L	H	A	F	L	D	G	R	D	T	P	P	R	S	A	E	S	S	L	K	K	F	E	E	K	F	A	A	L	G	K	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	A	S	I	I	G	R	Y	Y	A	M	D	R	D	N	R	W	D	R	V	E	K	A	Y	D	L	L	T	L	A	Q	G	E	F	Q	A	D	T	A	V	A	G	L	Q	A	A	Y	A	R	D	E	N	D	E	F	V	K	A	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	R	A	E	G	Q	P	D	A	A	M	E	D	G	D	A	L	I	F	M	N	F	R	A	D	R	A	R	E	I	T	R	A	F	V	N	A	D	F	D	G	F	A	R	K	K	V	V	N	V	D	F	V	M	L	T	E	Y	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																																																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	I	K	T	A	V	A	Y	P	P	A	S	L	V	N	T	F	G	E	W	M	A	K	N	D	K	T	Q	L	R	I	S	E	T	E	K	Y	A	H	V	T	F	F	F	N	G	G	V	E	E	S	F	K	G	E	D	R	I	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	S	P	K	V	A	T	Y	D	L	Q	P	E	M	S	S	A	E	L	T	E	K	L	V	A	A	I	K	S	G	K	Y	D	T	I	I	C	N	Y	P	N	G	D	M	V	G	H	T	G	V	M	E	A	A	V	K	A	V	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	D	H	C	V	E	E	V	A	K	A	V	E	S	V	G	G	Q	L	L	I	T	A	D	H	G	N	A	E	Q	M	R	D	P	A	T	G	Q	A	H	T	A	H	T	N	L	P	V	P	L	I	Y	V	G	D	K	N	V	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Sequence		V	E	G	G	K	L	S	D	I	A	P	T	M	L	S	L	M	G	M	E	I	P	Q	E	M	T	G	K	P	L	F	I	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																											?		?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand