Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39282 Date Thu Jan 5 11:58:52 GMT 2012 Unique Job ID 1eba11366d35164b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	H	T	I	K	K	M	S	L	I	G	L	I	L	M	I	F	T	S	V	F	G	F	A	N	S	P	S	A	Y	Y	L	M	G	Y	S	A	I	P	F	Y	I	F	S	A	L	L	F	F	I	P	F	A	L	M	M	A	E	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																			?							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	A	A	Y	R	K	E	E	G	G	I	Y	S	W	M	N	N	S	V	G	P	R	F	A	F	I	G	T	F	M	W	F	S	S	Y	I	I	W	M	V	S	T	S	A	K	V	W	V	P	F	S	T	F	L	Y	G	S	D	M	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?				?	?																																																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	H	W	R	I	A	G	L	E	P	T	Q	V	V	G	L	L	A	V	A	W	M	I	L	V	T	V	V	A	S	K	G	I	N	K	I	A	R	I	T	A	V	G	G	I	A	V	M	C	L	N	L	V	L	L	L	V	S	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	L	L	L	N	G	G	H	F	A	Q	D	I	N	F	L	A	S	P	N	P	G	Y	Q	S	G	L	A	M	L	S	F	V	V	F	A	I	F	A	Y	G	G	I	E	A	V	G	G	L	V	D	K	T	E	N	P	E	K	N	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	K	G	I	V	F	A	A	I	V	I	S	I	G	Y	S	L	A	I	F	L	W	G	V	S	T	N	W	Q	Q	V	L	S	N	G	S	V	N	L	G	N	I	T	Y	V	L	M	K	S	L	G	M	T	L	G	N	A	L	H	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?			?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	P	E	A	S	L	S	L	G	V	W	F	A	R	I	T	G	L	S	M	F	L	A	Y	T	G	A	F	F	T	L	C	Y	S	P	L	K	A	I	I	Q	G	T	P	K	A	L	W	P	E	P	M	T	R	L	N	A	M	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	S	I	A	M	W	M	Q	C	G	L	V	T	V	F	I	L	L	V	S	F	G	G	G	T	A	S	A	F	F	N	K	L	T	L	M	A	N	V	S	M	T	L	P	Y	L	F	L	A	L	A	F	P	F	F	K	A	R	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	D	R	P	F	V	I	F	K	T	H	L	S	A	M	I	A	T	V	V	V	V	L	V	V	T	F	A	N	V	F	T	I	I	Q	P	V	V	E	A	G	D	W	D	S	T	L	W	M	I	G	G	P	V	F	F	S	L	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Sequence		M	A	I	Y	Q	N	Y	C	S	R	V	A	K	N	P	Q	W	A	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand