Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P23842 Date Thu Jan 5 11:39:48 GMT 2012 Unique Job ID 1e8994c8d0037871

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	V	E	H	N	L	I	K	N	I	K	I	F	T	L	A	F	T	L	T	V	V	L	I	Q	L	S	R	F	I	S	P	L	A	I	I	H	S	S	Y	I	F	L	A	W	M	P	L	C	V	M	L	S	I	L	F	I	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	R	G	V	V	P	V	L	C	G	M	F	C	T	N	L	W	N	F	H	L	S	F	L	Q	T	A	V	M	L	G	S	Q	T	F	V	V	L	C	A	C	A	I	L	R	W	Q	L	G	T	R	W	R	Y	G	L	T	S	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?									?																				?		?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		V	W	Q	R	L	F	W	L	G	L	V	T	P	I	G	I	K	C	S	M	Y	L	V	G	S	F	F	D	F	P	L	K	I	S	T	F	F	G	D	A	D	A	I	F	T	V	V	D	L	L	S	L	F	T	A	V	L	I	Y	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	L	F	Y	Y	L	T	R	M	I	V	S	P	H	F	A	Q	I	L	W	R	R	D	I	A	P	S	L	G	K	E	K	R	A	F	T	L	S	W	L	A	A	L	S	V	L	L	L	L	L	C	T	P	Y	E	N	D	F	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?													?	?	?	?																											?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	Y	L	V	P	V	F	F	I	I	F	T	L	G	V	G	K	L	R	Y	P	F	L	N	L	T	W	A	V	S	T	L	C	L	L	N	Y	N	Q	N	F	L	Q	G	V	E	T	E	Y	S	L	A	F	I	L	A	V	L	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																										?	?	?	?					?				?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	S	V	C	L	L	Y	M	V	R	I	Y	H	R	S	E	W	L	N	R	R	W	H	L	Q	A	L	T	D	P	L	T	L	L	P	N	F	R	A	L	E	Q	A	P	E	Q	E	A	G	K	S	F	C	C	L	R	I	D	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	F	M	S	R	H	Y	G	L	M	M	R	V	H	C	I	R	S	I	C	R	T	L	L	P	L	M	Q	E	N	E	K	L	Y	Q	L	P	G	S	E	L	L	L	V	L	S	G	P	E	T	E	G	R	L	Q	H	M	V	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	N	S	R	Q	I	H	W	N	N	T	G	L	D	M	G	Y	G	A	A	W	G	R	F	D	G	N	Q	E	T	L	Q	P	L	L	G	Q	L	S	W	L	A	E	Q	S	C	A	H	H	H	V	L	A	L	D	S	R	E	E	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	S	G	Q	T	T	K	Q	V	L	L	L	N	T	I	R	T	A	L	D	Q	G	D	L	L	L	Y	A	Q	P	I	R	N	K	E	G	E	G	Y	D	E	I	L	A	R	L	K	Y	D	G	G	I	M	T	P	D	K	F	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	I	A	Q	F	N	L	S	A	R	F	D	L	Q	V	L	E	S	L	L	K	W	L	A	T	H	P	C	D	K	K	G	P	R	F	S	V	N	L	M	P	L	T	L	L	Q	K	N	I	A	G	R	I	I	R	L	F	K	R	Y
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Disorder																																?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		H	I	S	P	Q	A	V	I	L	E	I	T	E	E	Q	A	F	S	N	A	E	S	S	M	Y	N	I	E	Q	L	H	K	F	G	F	R	I	A	I	D	D	F	G	T	G	Y	A	N	Y	E	R	L	K	R	L	Q	A	D	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		K	I	D	G	V	F	V	K	D	I	V	T	N	T	L	D	A	M	I	V	R	S	I	T	D	L	A	K	A	K	S	L	S	V	V	A	E	F	V	E	T	Q	Q	Q	Q	A	L	L	H	K	L	G	V	Q	Y	L	Q	G	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	G	R	P	Q	P	L	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand