Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45804 Date Thu Jan 5 12:03:49 GMT 2012 Unique Job ID 1e3cecdfbfaf4d4f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	N	V	E	L	S	P	A	T	R	W	G	M	I	A	T	G	L	L	Q	G	L	V	C	Y	L	L	I	A	W	L	S	G	K	N	H	S	W	I	V	Y	G	V	P	A	T	V	A	F	S	S	V	L	L	F	S	V	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?			?	?																																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	K	Q	K	R	L	W	G	W	L	A	L	V	F	I	A	T	L	G	M	S	G	W	L	K	W	Q	T	D	G	M	N	P	W	R	A	E	K	A	L	W	D	F	G	C	Y	L	L	L	M	A	M	L	L	L	P	W	I	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																														?	?	?	?	?			?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	L	R	I	R	N	D	S	S	R	Y	R	Y	F	Y	Q	S	V	W	H	N	V	L	I	L	L	V	I	F	L	A	N	G	L	T	W	L	V	L	L	L	W	S	E	L	F	K	L	V	G	I	T	F	F	N	T	L	F	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	D	W	F	I	Y	L	T	L	G	L	V	T	A	L	A	V	I	L	A	R	T	Q	S	R	L	I	D	S	I	Q	K	L	F	T	L	I	A	T	G	L	L	P	L	V	S	L	L	T	L	M	F	I	I	T	L	P	F	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?		?																																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	S	A	I	S	R	H	I	S	A	A	G	L	L	L	T	L	A	F	L	Q	L	I	L	M	A	I	V	R	D	P	Q	K	A	S	L	P	W	T	G	P	L	R	C	L	I	K	T	A	L	L	V	A	P	L	Y	V	F	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	W	A	L	W	L	R	V	A	Q	Y	G	W	T	V	D	R	L	Q	G	V	L	A	V	L	V	L	L	V	W	S	L	G	Y	F	V	S	I	V	W	R	K	G	Q	N	P	V	V	L	Q	G	K	V	N	L	A	V	S	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	L	V	I	L	V	L	L	N	S	P	V	L	D	S	M	R	I	S	V	N	S	H	M	A	R	Y	Q	S	G	K	N	T	S	D	Q	V	T	I	Y	M	L	E	Q	S	G	R	Y	G	R	A	A	L	E	S	L	K	S	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	F	M	K	D	P	K	R	A	R	D	L	L	M	A	L	D	G	E	Q	H	L	Q	Q	Q	V	S	E	K	V	L	A	D	N	V	L	I	A	P	G	S	V	K	P	D	A	T	F	W	S	A	L	I	Q	D	R	Y	N	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?				?	?	?	?	?		?											?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		T	C	I	E	K	D	A	C	V	L	V	E	Q	D	L	N	S	D	G	Q	A	E	R	I	L	F	A	F	N	D	D	R	V	I	V	Y	G	F	D	S	D	R	K	E	W	D	A	L	D	M	S	L	L	P	N	E	I	T	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?																																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
Sequence		K	L	L	T	A	A	K	D	G	K	L	G	T	K	P	K	A	W	R	D	L	V	V	D	G	E	R	L	N	V	N	L	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?				?	?		?	?											?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand