Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0C8K0 Date Thu Jan 5 11:30:07 GMT 2012 Unique Job ID 1dcd00b699723ca4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	H	L	T	E	M	V	R	Q	H	K	A	G	K	T	N	G	I	Y	A	V	C	S	A	H	P	L	V	L	E	A	A	I	R	Y	A	S	A	N	Q	T	P	L	L	I	E	A	T	S	N	Q	V	D	Q	F	G	G	Y	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?										?																																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	M	T	P	A	D	F	R	G	F	V	C	Q	L	A	D	S	L	N	F	P	Q	D	A	L	I	L	G	G	D	H	L	G	P	N	R	W	Q	N	L	P	A	A	Q	A	M	A	N	A	D	D	L	I	K	S	Y	V	A	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	K	K	I	H	L	D	C	S	M	S	C	Q	D	D	P	I	P	L	T	D	D	I	V	A	E	R	A	A	R	L	A	K	V	A	E	E	T	C	L	E	H	F	G	E	A	D	L	E	Y	V	I	G	T	E	V	P	V	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?		?									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	A	H	E	T	L	S	E	L	A	V	T	T	P	D	A	A	R	A	T	L	E	A	H	R	H	A	F	E	K	Q	G	L	N	A	I	W	P	R	I	I	A	L	V	V	Q	P	G	V	E	F	D	H	T	N	V	I	D	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	A	K	A	S	A	L	S	Q	M	V	E	N	Y	E	T	L	I	F	E	A	H	S	T	D	Y	Q	T	P	Q	S	L	R	Q	L	V	I	D	H	F	A	I	L	K	V	G	P	A	L	T	F	A	L	R	E	A	L	F	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	A	I	E	E	E	L	V	P	A	K	A	C	S	G	L	R	Q	V	L	E	D	V	M	L	D	R	P	E	Y	W	Q	S	H	Y	H	G	D	G	N	A	R	R	L	A	R	G	Y	S	Y	S	D	R	V	R	Y	Y	W	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?										?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	Q	I	D	D	A	F	A	H	L	V	R	N	L	A	D	S	P	I	P	L	P	L	I	S	Q	Y	L	P	L	Q	Y	V	K	V	R	S	G	E	L	Q	P	T	P	R	E	L	I	I	N	H	I	Q	D	I	L	A	Q	Y	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.
Sequence		T	A	C	E	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand