Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P26266 Date Thu Jan 5 11:42:50 GMT 2012 Unique Job ID 1d20f32957d51675

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	S	L	N	I	K	Q	G	S	D	A	H	F	P	D	Y	P	L	A	S	P	S	N	N	E	I	D	L	L	N	L	I	S	V	L	W	R	A	K	K	T	V	M	A	V	V	F	A	F	A	C	A	G	L	L	I	S	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	P	Q	K	W	T	S	A	A	V	V	T	P	P	E	P	V	Q	W	Q	E	L	E	K	S	F	T	K	L	R	V	L	D	L	D	I	K	I	D	R	T	E	A	F	N	L	F	I	K	K	F	Q	S	V	S	L	L	E	E	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	R	S	S	P	Y	V	M	D	Q	L	K	E	A	K	I	D	E	L	D	L	H	R	A	I	V	A	L	S	E	K	M	K	A	V	D	D	N	A	S	K	K	K	D	E	P	S	L	Y	T	S	W	T	L	S	F	T	A	P	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	E	E	A	Q	T	V	L	S	G	Y	I	D	Y	I	S	T	L	V	V	K	E	S	L	E	N	V	R	N	K	L	E	I	K	T	Q	F	E	K	E	K	L	A	Q	D	R	I	K	T	K	N	Q	L	D	A	N	I	Q	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	Y	S	L	D	I	A	N	A	A	G	I	K	K	P	V	Y	S	N	G	Q	A	V	K	D	D	P	D	F	S	I	S	L	G	A	D	G	I	E	R	K	L	E	I	E	K	A	V	T	D	V	A	E	L	N	G	E	L	R	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	Q	Y	L	V	E	Q	L	T	K	A	H	V	N	D	V	N	F	T	P	F	K	Y	Q	L	S	P	S	L	P	V	K	K	D	G	P	G	K	A	I	I	V	I	L	S	A	L	I	G	G	M	V	A	C	G	G	V	L	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?		?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	A	M	A	S	R	K	Q	D	A	M	M	A	D	H	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?			?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand